RICERCA ITALIANA     

Un efficiente strategia per l’ identificazione di geni coinvolti nell’ espressione di malattie comuni: applicazione alla schizofrenia

Abstract

Una delle piu’ importanti promesse della ricerca biomedica e’ la possibilita’ di identificare i geni coinvolti nell’espressione di comuni malattie di origine complessa come l’asma, il cancro, l’Alzheimer, la schizofrenia ecc. La ricerca genomica dispone oggi di nuove metodiche e dati per raggiungere questi obiettivi. Tra questi ultimi sono compresi la sequenza del genoma umano, due milioni di polimorfismi nucleotidici bi-allelici (SNPs) e, molto recentemente, il progetto HapMap che mira a definire la composizione aplotipica dei cromosomi umani .

Questo progetto rappresenta un’occasione unica per sviluppare ed applicare efficienti strategie che permettano di individuare i fattori genetici ed ambientali responsabili della schizophrenia (MIM 181500), una frequente malattia psichiatrica che colpisce circa l’1% della popolazione generale.

La parte fondamentale del progetto e’ basata su una dettagliata analisi genomica per mezzo dei chips Affymetrix che permettono di studiare la variabilita’ individuale in 50,000 siti nucleotidici (SNPs). La collaborazione Italia/Israele offre l’opportunita’ unica di sviluppare ed applicare due efficienti strategie popolazionistiche in gruppi di pazienti schizofrenici e controlli raccolti in Israele ed in Sardegna. Il materiale israeliano include 600 campioni di DNA gia’ raccolti da pazienti e da 600 controlli normali entrambi appartenenti alla popolazione ebraica Ashkenazi. I DNA sardi includeranno 200 pazienti>>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca

Marcello SINISCALCO, CNR

Obiettivo del Finanziamento

L’ obiettivo primario del presente progetto e’ la dissezione delle basi genetiche della schizofrenia attraverso la ricerca sistematica di associazioni iterative tra malattia e specifici SNP in due popolazioni omogenee come gli Askenazi di Israele e una serie di villaggi isolati della Sardegna. Le singolari connotazioni di questi due gruppi popolazionistici associate alla disponibilita’ di SNP-chip ad alta densita’ offrono l’ opportunita’ di affrontare sistematicamente lo studio di malattie complesse, uno dei piu’ difficili ed urgenti problemi della genetica contemporanea. In particolare ci si attende che la descrizione (in termini di SNP) della struttura genomica degli isolati Sardi e degli Askenazi israeliani divenga la base informativa necessaria per ricercare le basi genetiche di qualunque altra malattia complessa come il diabete, l’ asma, l’ ipertensione, il cancro etc. Va sottolineato che uno dei piu’ importanti obiettivi iniziali del progetto sara’ l’ elaborazione pertinente degli SNP-chip ad alta densita’ dell’ Affymetrix e la valutazione del loro potenziale per l’ analisi dei DNA-pool che accrescerebbe in modo notevole la realizzazione del presente progetto e, in generale, di tutti quelli che ne utilizzassero le strategie proposte. A questo proposito riteniamo che i risultati derivati dall’ applicazione di queste ultime e, sul piano tecnologico, dall’ analisi dei DNA-pool con SNP-chip ad alta densita’ possano aprire la strada al loro uso generalizzato nella>>>

Durata

36 mesi