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SCHEDA FIRB
italiano - english
Unità di Ricerca
- Universita' degli Studi di ROMA "La Sapienza"
Dip. BIOTECNOLOGIE CELLULARI ED EMATOLOGIA, ROMA (RM) - Universita' degli Studi di ROMA "La Sapienza"
Dip. BIOTECNOLOGIE CELLULARI ED EMATOLOGIA, ROMA (RM) - Consiglio nazionale delle ricerche (CNR)
Istituto Tecnologie Biomediche, ROMA (RM) - Universita' degli Studi di NAPOLI "Federico II"
Dip. BIOLOGIA E PATOLOGIA CELLULARE E MOLECOLARE, NAPOLI (NA) - FONDAZIONE ANDREA CESALPINO
Laboratorio di Espressione Genica, ROMA (RM)
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- 9 - Il sistema di trasduzione del segnale Ca2+: dalle molecole alle funzioni
- 10 - Meccanismi di regolazione dello sviluppo del sistema nervoso e del differenziamento neurale (PRONEURO)
Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Classificazione geografica
- Regione: Lazio
Bibliografia
1) Van Holde KE (1988) Chromatin Springer Verlag, New York2) Finch JT and Klug A (1976) Proc Natl Acad Sci USA 73,1897
3) Woodcock, CLF et al (1984) J Cell Biol 99, 42
4) Widom J(1986) J Mol Biol 190, 411
5) Felsenfed G and McGhee JD (1986) Cell 44, 375
6) Thoma Fet al (1979) J Cell Biol 83, 403
7) Thomas JO and Khabaza A J A (1980) Eur J Biochem 112, 501
8) Allan J et al (1981) J Cell Biol 90, 279
9) De Bernardin et al (1986) J Mol Biol 189, 503
10) Allan J et al (1982) JCell Biol 93, 285
11) Leuba SH et al (1998) Biophysical J 74, 2830
12) McGhee JD and Fenselfeld G (1980) Ann Rev Biochem 49, 1115
13) Leuba SH et al (1993) J Mol Biol 229, 917
14) Graziano V et al (1994) Nature 386, 351
15) McGhee JD et al (1980) Cell 22, 87
16) McGhee J et al (1983) Cell 33, 831
17) Woodcoock CL et al (1993) Proc Natl Acad Sci USA 90, 9021
18) Woodcock CL and Horowitz RA (1995) Trends Cell Biol 5, 272
19) Van Holde K and Zlatanova J (1995). J Biol Chem 270, 8373
20) Zlatanova J and van Holde K (1992) Crit Rev Euk Gene Expr 2, 211
21) Bode J et al (1996) Crit Rev Euk Gene Expr 6, 115
22) Hart CM and Laemmli UK (1998). Curr Op Genet Dev 8, 519
23) Laemmli UK et al (1992) Curr Opin Genet Dev 2, 275
24) Berezney R et al (1995) Int Rev Cytol 162A, 2
25) Nickelson JA et al (1995) Int.Rev Cytol 162A, 67
26) Few EG and Penman S (1988) Proc Natl Acad Sci USA 85, 121
27) Getzenberg RH (1994) J Cell Biochem 55, 22
28) Dworetzky SI et al(1990) Proc Natl Acad Sci USA 87, 4605
29) Samuel SK et al (1997) Cancer Res. 57, 147
30) Stein GS et al (1998) J Cell Biochem 55, 4
30a) Deppert W (2000) Crit. Rev. Euckariot. Gene Expr. 10, 45
31) Zlatanova J et al (2000) The FASEB J 14,1697
32) Davie JR (1998) Curr Opin Genet Dev 8, 173
33) Lovell-Badge R (1995) Nature 376, 725
34) Bustin M (1999) Mol Cell Biol 19, 5237
35) Zhou X et al (1995) Nature 376, 771
36) Chiappetta G et al (1996) Oncogene, 13, 2439
37) Giancotti,V. et al . (1987) Embo J. 6, 1981
38) Chiappetta G. et al. (1995) Oncogene, 10, 1307
39) Berlingieri MT et al. (1995) Mol Cell Biol 15, 1545
40) Fedele M et al Carcinogenesis, October 2001
41) Bestor TH and Ingram VM (1983) Proc Natl Acad Sci 80, 5559
42) Clark S et al (1995) Nat Genet 10, 20
43) Gruenbaum Y et al (1981) FEBS Lett 124, 67
44) Ysraeli J and Szyf M (1984) DNA methylation and Biological significance
353 (Razin et al. eds.) Springer-Verlag NY
45) Bird AP et al (1985) Cell 40, 91
46) Bird AP (1986) Nature 321, 209
47) Razin A and Riggs AD (1980) Science 210, 604
48) Leonhardt H et al (1992) Cell 71, 865
49) Bird AP and Wolffe AP (1999) Cell 451
50) Okano M et al (1999) Cell 99, 247
51) Jost JP et al (1995) J Biol Chem 270, 9734
52) Weiss A et al (1996) Cell 86, 709
53) Bhattacharya SK et al (1999) Nature 397, 579
54) Antequera F and Bird AP (1999) Curr Biol 9, R661
55) Jones PA (1999) Trends Genet 15, 34
56) Keshet I et al (1985) Proc Natl Acad Sci 82, 2560
57) Bestor TH et al (1992) Genet Anal Tech Appl 9, 48
58) Szyf M et al (1990) Mol Cell Biol 10, 4396
59) Christman JK et al (1995) Proc Natl Acad Sci 92, 7347
60) Tollefsbol TO et al (1997) J Mol Biol 269, 494
61) Szyf M (1991) Biochem Cell Biol 69, 764
62) Brandeis M et al (1994) 371, 435
63) MaCleod D et al (1994) Genes Dev 8, 2282
64) Huang L et al (1984) Nature 308, 293
65) Zhang XY et al (1986) Nucl Acids Res 14, 8387
66) Khan R et al (1988) J Biol Chem 263, 14374
67) Pawlak A et al (1991) Nucl Acids Res 19, 1029
68) Jost JP and Hofsteenge J (1992) Proc Natl Acad Sci 89, 9499
69) Zhang XY et al (1995) Nucl Acids Res 23, 3026
70) Meehan RR et al (1989) Cell 58, 499.
71) Boyes J and Bird AP (1991) Cell 64, 1123
72) Lewis JD et al (1992) 69, 905
73) Boyes J and Bird AP (1992) EMBO J 11, 327
74) Meehan RR et al (1992) Nucl Acids Res 20, 5085
75) Nan X et al (1997) Cell 88, 471
76) Nan X et al (1998) Nature 393, 386
77) Jones PL et al (1998) Nature Genet 19, 187
78) Zardo G et al (1997) Biochemistry 36, 7937
79) De Capoa A et al (1999) The FASEB J 13, 89
80) Zardo G et al (1999) The Faseb J 13, 1518
81) Zardo G and Caiafa P (1998) J Biol Chem 273, 16517
82) Hendrich B and Bird AP (1998) Mol Cell Biol 18, 6538
83) Hendrich B. (2000) Curr Biol 10, R60
84) Santoro R. et al (1995) Biochem J 305, 739
85) Zardo G et al (1998) Biol. Chem. 379, 647
86) Prosperi E. (1997) Prog. Cell Cycle Res 3, 193
87) Chuang, LS-H et al (1997) Science 277, 1996
88) Li E et al (1992) Cell 69, 915
89) Brandeis M et al (1993) Bioessays 15, 709
90) Tilghman SM (1999) Cell 96, 185
91) Feinberg AP (1999) Cancer Res 59, 1743S
92) Jones P.A et al (1992) Bioessay 14, 33
93) Rideout WM et al. (1990) Science 249, 1288
94) Denissenko M.F et al (1997) Proc Natl Acad Sci 94, 3893
95) Chen JX et al (1998) Cancer Res 58, 2070
96) Feinberg AP and Vogelstein B (1983) Nature 301, 89
97) Gama-Sosa M.A et al (1983) Nucl Acids Res 11, 6883
98) Goelz SE and Vogelstein B (1985) Science 228, 187
99) Feinberg AP et al (1988) Cancer Res 48, 1159
100) Kim YI et al (1994) Cancer 74, 893
101) Laird PW and Jaenisch R (1994) Hum Mol Genet 3, 1487
102) de Capoa A et al (1999) Cytometry 36, 157
103) Sakai T et al. (1991) Am J Hum Genet 48, 880
104) Herman J.G et al. (1994) Proc Natl Acad Sci 91, 9700
105) Graff JR et al (1995) Cancer Res. 55, 5195
106) Merlo A et al (1995) Nature Med 1, 686
107) Baylin SB (1997) Science 277, 1948
108) Selig S et al (1992) EMBO J 11, 1217
109) Mendoza-Alvarez H and Alvarez-Gonzalez R (1993) J Biol Chem 268, 22575
110) Kawaichi M et al (1981) J Biol Chem 256, 9483
111) Desmarais Y et al (1991) Biochim Biophys Acta 1078, 179
112) Alvarez-Gonzalez R and Jacobson MK (1987) Biochemistry 26, 3218
113) Ménissier de Murcia et al. (1989) J Mol Biol 210, 229
114) Gradwohl G (1990) Proc Natl Acad Sci USA 87, 2990
115) Ikejma M et al. (1990). J Biol Chem 265, 21907
116) de Murcia G and Ménissier de Murcia J (1994) Trends Biochem. Sci. 19, 172
117) de Murcia G et al (1995) Trends Cell Biol 5, 78
118) Ferro A.M. Higgins NP and Olivera BM (1983) J Biol Chem 258, 6000
119) Yoshihara K et al (1985) Biochem Biophys Res Commun 128, 61
120) Boulikas T (1989) Proc Natl Acad Sci USA 86, 3499
121) Scovassi AI et al (1993) Exp Cell Res 206, 177
122) Amè J-C et al. (1999) J Biol Chem 274, 17860
123) Berghammer H et al (1999) FEBS Letters 449, 259
124) Wang Z-Q et al (1995) Genes and Dev 9, 509
125) Shieh WM et al (1998) J Biol Chem 273, 30069
126) Smith S (2001) Trends in Biochem Sci 26, 174
127) Pleschke JM et al (2000) J Biol Chem 275,40974
128) D'Erme M et al (1996) Biochem J 316, 475
129) Naegeli H and Althaus FR (1991) J Biol Chem 266, 10596
130) Panzeter PL et al (1992) Biochemistry 31, 1379
131) Jeggo PA (1998) Current Biol. 8, 49
132) Bürkle A (2001) Cancer Letters 163, 1
133) Duriez P and Shah GM (1997).Biochem Cell Biol 75, 337
134) Soldani C et al (2001) Exp Cell Res 269, 193
135) Negri C et al. (1997) Exp Cell Res 234, 174
136) Scovassi AI and Poirier GG (1999) Mol Cell Biochem 199, 125
137) Bernardi R et al. (1997). Biochim. Biophys Acta 1338, 60
138) Affar EB et al. (2001) J Biol Chem 273: 2935
139) Yoon Yset al (1996) J Biol Chem. 271, 9129
140) Diana F et al (2001) J Biol Chem 276, 11354
141) Kratzmeier M et al (2000) J Biol Chem 275, 30478
142) Montecucco A et al (2001) Mol Biol Cell 12, 2109
143) Ichijo H et al (1997) Science 275, 90
144) Kawai T et al (1999) Oncogene 18, 3471
145) Cohen PTW (1997) Trends Biochem Sci 22: 245
146) Torchia J et al (1998) Curr Opin Cell Biol 10, 373
147) Luo RX (1998) Cell 92:463-73
148) Puri PL (1997) Mol Cell 1, 35
149) Costanzo A et al. (2001) Mol Cell (submitted)
150) Sartorelli V (1999) Mol Cell 4, 725
151) Zeng (2000) Mol Cell Biol 20, 1299.
152) Archer SY and R. A. Hodin (1999) Curr Opin Genet Dev 9, 171
153) Bird AP and A. P. Wolffe (1999) Cell 99, 451
154) Pabo CO et al (2001) Annu. Rev Biochem 70, 313
155) Corbi N et al (1998) Biochem Biophys Res Commun. 253, 686
156) Corbi N et al (2000) Gene therapy 7, 1076
Parole Chiave
CROMATINA; METILAZIONE DEL DNA; POLI(ADP-RIBOSILAZIONE); ACETILAZIONE; FOSFORILAZIONE; MATRICE NUCLEAREEpigenetica e cromatina
Università degli Studi di Roma "La Sapienza"Abstract
La scelta del titolo "epigenetica e cromatina" (EpiChrom) per il progetto che qui di seguito presentiamo, deriva dalle caratteristiche proprie delle modificazioni dell'espressione genica che intendiamo studiare. Infatti, il termine "epigenetica" secondo una delle interpretazioni possibili, racchiude quei processi che non possono essere compresi nella definizione di gene e di genetica, includendo anche i meccanismi che regolano l'espressione del gene. Nella parola epigenetica "epi" indica tutto ciò che "circonda" la genetica intendendo per circondare tutto ciò che accade oltre ed intorno alla stretta informazione genetica. Questo termine si riferisce quindi a tutti i processi che giocano un ruolo chiave nella trasformazione dal genotipo al fenotipo. La scelta di concentrare la nostra attenzione sulla cromatina è dovuta alla necessità di limitare il campo dell' epigenetica a quei fenomeni che più strettamente riguardano le modificazioni strutturali e biochimiche del materiale genetico e che sono coinvolti nella modulazione dell'espressione genica. Sono state descritte varie modificazioni che possono intervenire sia direttamente sul DNA che su diverse proteine della cromatina. Inoltre, a dimostrazione di quanto siano complesse le regolazioni della struttura della cromatina è noto che la stessa proteina cromatinica può subire più di una sola modificazione. Per questa ragione ogni unità di ricerca di questo progetto si concentrerà sullo studio di alcuni aspetti del problema con>>>Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
PAOLO AMATI, Universita' degli Studi di ROMA "La Sapienza"Obiettivo del Finanziamento
All'interno dei nuclei il DNA è organizzato nella cromatina. Nell'era della post-genomica lo sforzo maggiore è teso alla comprensione di come la cromatina, lo stampo fisiologico di tutte le informazioni genetiche degli eucarioti, è soggetta a diverse modificazioni post-sintetiche. Queste modificazioni coinvolgono primariamente sia gli istoni del "core" che quelli del DNA internucleosomiale, ma giocano un ruolo molto importante nella modulazione dei fattori di trascrizione, dei co-attivatori e dei co-repressori. Stanno inoltre crescendo le evidenze che indicano come le modificazioni post-traduzionali possono dirigere alcuni fattori di trascrizione su uno o un sottogruppo di geni allo scopo di associare a differenti stimoli specifici, adeguate risposte cellulari.Il processo di rimodellamento cromatinico è in parte dovuto a proteine chiamate "fattori di rimodellamento". Consideriamo in particolare CAF-1 che inserisce particelle "core" sul DNA appena replicato. CAF-1- che è un complesso trimerico - svolge questa funzione attraverso la sua subunità più grande che è in grado di legare selettivamente PCNA, una proteina coinvolta nella replicazione. E' interessante notare che HD1 (istone deacetilasi1) è anche associato con CAF-1 attraverso il legame con la sua subunità più piccola. E' sempre più evidente che la struttura e le funzioni della cromatina dipendono da meccanismi epigenetici. In questo specifico caso HD1 potrebbe intervenire nella deacetilazione degli istoni del>>>



