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SCHEDA FIRB
italiano - english
Unità di Ricerca
- Universita' degli Studi di BARI
BIOCHIMICA E BIOLOGIA MOLECOLARE, MILANO (MI) - Universita' degli Studi di MILANO
Dip. FISIOLOGIA E BIOCHIMICA GENERALI, MILANO (MI) - Universita' degli Studi di ROMA "Tor Vergata"
Dip. BIOLOGIA, ROMA (RM) - Universita' degli Studi di PALERMO
Dip. MATEMATICA E APPLICAZIONI, PALERMO (PA) - Universita' degli Studi di BOLOGNA
Dip. BIOLOGIA EVOLUZIONISTICA SPERIMENTALE, BOLOGNA (BO) - CINECA
Sistemi ad Alte Prestazioni, BOLOGNA (BO) - Universita' degli Studi di PADOVA
Dip. BIOLOGIA, PADOVA (PD)
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- 6 - Nuove Metodologie e tecnologie integrate per la documentazione e restauro dei complessi archeologici e monumentali mediterranei.
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Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Classificazione geografica
- Regione: Lombardia
Bibliografia
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Parole Chiave
Bioinformatica; Banche Dati; Genomica; Proteomica; Trascrittoma; Biologia ComputazionaleBioinformatica per la Genomica e la Proteomica
Università degli Studi di BariAbstract
La Bioinformatica è una disciplina sviluppatasi nell'ultimo ventennio in seguito alle crescenti esigenze della moderna ricerca biologica correlate con l'incessante sviluppo delle Biotecnologie, che sta producendo sempre nuovi e diversificati tipi di dati in quantità massiva. Il più grande apporto di tali dati deriva dagli sforzi coordinati a livello mondiale rivolti al sequenziamento di interi genomi di molti organismi,procarioti ed eucarioti, sia nucleari che di organelli primo fra tutti il Genoma Umano. Ai dati genomici si aggiungono i dati derivati dalla analisi dei profili di espressione mediante l'uso dei microarrays e da analisi proteomiche mediante nuove e avanzate tecnologie quali i nuovi spettrometri di massa che consentono uno studio globale dei proteomi. Siamo nella Era Post-Genomica che sta aprendo una nuova visione della biologia e nuove prospettive nel settore biomedico relativamente allo studio e alla terapia di patologie genetiche, nel settore farmacologico per la progettazione di nuovi farmaci e nel settore agroalimentare per il miglioramento dei prodotti nutrizionali. In tale scenario le Unità di Bari (C.Saccone), Milano (G.Pesole), Padova (G.Valle), Bologna (R.Casadio), Cineca (E.Rossi), Roma (M.Helmer-Citterich) e Palermo (R.Giancarlo), costituite tutte da ricercatori con rilevanti competenze, coordinate da C.Saccone, che da oltre un ventennio svolge un ruolo leader nel settore della Bioinformatica e Genomica sia a livello nazionale che internazionale>>>Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Cecilia SACCONE, Universita' degli Studi di BARIObiettivo del Finanziamento
I principali obiettivi del progetto sono:a) Progetto e sviluppo di banche dati specializzate con sistemi di interrogazione mirati.
La post-genomica produce nuovi e diversificati dati in relazione a nuovi progetti genomici e all'emergere di nuove tecnologie: ne deriva quindi l'esigenza di disegnare modelli di banche dati che possano essere utilizzati da laboratori differenti, produttori di dati relativi a genomi e proteomi.
In questo contesto, verranno realizzate nuove banche dati correlate a studi di genomica funzionale basate su tecnologie di microarrays e di spettrometria di massa, rispettivamente per lo storage di dati di espressione genica e di dati sul proteoma.
Inoltre, ci si propone di aggiornare e mantenere le banche dati biologiche già sviluppate dai proponenti e garantirne la loro interoperabilità e visibilità attraverso il portale di Bioinformatica (obiettivo e.I).
Verranno sviluppati nuovi strumenti per la gestione e l'utilizzo di banche banche dati biologiche quali tecniche di compressione di dati e di indicizzazione multidimensionale.
b) Incrementare gli strumenti di analisi della genomica e proteomica mediante nuovi algoritmi e software.
In questo ambito i metodi per l'analisi delle sequenze nucleotidiche e proteiche saranno perfezionati per permetterne la caratterizzazione funzionale, e determinare misure più accurate di distanze genetiche e produrre alberi filogenetici attendibili.
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