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INIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE

SCHEDA FIRB

italiano - english
Unità di Ricerca
  • Consorzio Interuniversitario Risonanze Magnetiche su Metalloproteine Paramagnetiche (CIRMMP)
    (CIRMMP), FIRENZE (FI)
  • BIONDUSTRY PARK DEL CANAVESE
    Laboratorio Integrato Metodologie Avanzate, TORINO (TO)
  • Universita' degli Studi di TRIESTE
    Dip. SCIENZE CHIMICHE, TRIESTE (TS)
  • CONSORZIO INTERUNIVERSITARIO DI RICERCA IN CHIMICA DEI METALLI NEI SISTEMI BIOLOGICI
    Consorzio con Personalit¿ Giuridica, BARI (BA)
  • IRBM P. ANGELETTI
    BIOCHIMICA, ROMA (RM)
FIRB simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
Classificazione geografica
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Parole Chiave
Metalloproteinasi di Matrice (MMP); Docking; NMR screening; Modeling di proteine; Determinazione strutturale di proteine

Elucidazione strutturale di bersagli proteici critici per malattie e studio delle basi molecolari della specificità dei candidati farmaci

Consorzio Interuniversitario Risonanze Magnetiche su Metalloproteine Paramagnetiche (CIRMMP)
Abstract
Nel progetto si svilupperanno metodologie integrate computazionali e sperimentali mirate allo sviluppo razionale di "drug lead" per bersagli molecolari critici per malattie. Le metodologie saranno basate sull'uso di ampie librerie, combinatoriali e non, di piccole molecole, peptidi e peptido-mimetici. Caratteristica fondamentale delle metodologie sviluppate sarà la loro alta produttività (high throughput), ossia la loro capacità di valutare in tempi brevi (dell'ordine di qualche settimana) il potenziale come candidati farmaci contro un determinato bersaglio molecolare critico per una malattia di un numero molto elevato (dell'ordine di 1000-10000) di composti chimici. A questo fine, l'interazione dei composti nelle librerie col bersaglio molecolare sarà dapprima valutata computazionalmente, quindi verificata sperimentalmente, tramite risonanza magnetica nucleare (NMR), surface plasmon resonance (SPR), saggi biochimici. Sulla base dei risultati di questi screening, i composti più promettenti verranno ottimizzati tramite sintesi chimica o chimica combinatoriale, e nuovamente sottoposti a screening. L'uso di metodi teorici in combinazione con studi sperimentali consentirà di concentrare questi ultimi solo sulle molecole aventi maggiori probabilità di successo (Maggio e Ramnarayan, Trends. Biotech., 2001, 266-272), portando di conseguenza a un notevole risparmio di risorse e tempo. I protocolli sviluppati avranno applicabilità generale per qualunque tipo di bersaglio proteico in>>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
IVANO BERTINI, Consorzio Interuniversitario Risonanze Magnetiche su Metalloproteine Paramagnetiche (CIRMMP)
Obiettivo del Finanziamento
L'obiettivo scientifico del progetto e' quello di individuare candidati farmaci in grado di interagire specificamente con bersagli molecolari scelti. I bersagli sono proteine critiche per alcune malattie, e sono stati ampiamente validati come bersagli farmacologici. L'approccio è assolutamente all'avanguardia per strumentazione a disposizione e esperienza dei ricercatori coinvolti. Ciò ci permette di disegnare una strategia integrata per la parte iniziale dello sviluppo di farmaci, capace di un'altissima produttività (high throughput) e per molti aspetti innovativa. Tale strategia parte dalla creazione di una banca dati di piccole molecole e dall'applicazione e validazione di metodi computazionali e arriva a proposte di candidati farmaci attraverso la produzione di essi, di bersagli proteici e attraverso lo screening in vitro. Saranno ottenute strutture degli addotti bersaglio:candidato farmaco. L'efficacia di piccoli composti sarà inizialmente valutata tramite metodologie computazionali. Il database di molecole sarà costruito principalmente sulla base di quello del National Cancer Institute americano (NCI) che contiene 250'000 molecole. Esso sarà integrato con polipeptidi e composti di chimica combinatoriale, tutti virtuali, che saranno progettati attraverso approcci computazionali (vedi dopo), tenendo in conto la nostra capacità di produrli. Le librerie virtuali di composti chimici descritte saranno assemblate utilizzando un formato elettronico ottimizzato per lo screening>>>

Durata
36 mesi