Contenuto
Ti trovi in: HOME »Programmi, progetti e risultati »I progetti »FIRB - Fondo per gli Investimenti della Ricerca di Base »scheda FIRBINIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE
SCHEDA FIRB
italiano - english
Unità di Ricerca
- Consiglio nazionale delle ricerche (CNR)
Istituto Biosintesi vegetali, MILANO (MI) - Universita' degli Studi di MILANO
Dip. SCIENZE MOLECOLARI AGROALIMENTARI, MILANO (MI) - Consiglio nazionale delle ricerche (CNR)
Istituto di Mutagenesi e Differenziamento Area della Ricerca di Pisa, PISA (PI) - Universita' degli Studi di PAVIA
Dip. GENETICA E MICROBIOLOGIA 'A.BUZZATI-TRAVERSO, PAVIA (PV) - Universita' degli Studi della TUSCIA
Dip. AGROBIOLOGIA E AGROCHIMICA, VITERBO (VT) - ISTITUTO SPERIMENTALE PER LA CEREALICOLTURA
SEZIONE DI BERGAMO, BERGAMO (BG) - Universita' degli Studi della TUSCIA
Dip. AGROBIOLOGIA E AGROCHIMICA, VITERBO (VT) - Consiglio nazionale delle ricerche (CNR)
Istituto di Ricerche sul Miglioramento Genetico delle Piante Foraggere, PERUGIA (PG)
FIRB simili:
- 1 - Epigenetica e cromatina
- 2 - Il riconoscimento molecolare nelle interazioni proteina-ligando, proteina-proteina e proteina superficie: sviluppo di approcci sperimentali e computazionali integrati per lo studio di sistemi di interesse farmaceutico
- 3 - PROTEASI NELLA RISPOSTA CELLULARE NORMALE E PATOLOGICA: IDENTIFICAZIONE DEI SUBSTRATI ENDOGENI E DEI MECCANISMI MOLECOLARI INDOTTI
- 4 - Genomica e Proteomica nello studio di funzioni cellulari complesse(GAP).
- 5 - Misfolding di proteine e patologie umane: studio della conversione patologica di proteine globulari in aggregati fibrillari e sviluppo di farmaci che inibiscano i processi di misfolding e aggregazione
- 6 - Meccanismi molecolari della morte cellulare e loro implicazione in patologia umana
- 7 - Identificazione di nuovi marcatori molecolari per la diagnosi e la prognosi del carcinoma renale con tecniche genomiche e proteomiche. (Possibile risultato atteso: Identificazione di nuovi marcatori diagnostici o prognostici di malattie).
- 8 - Sviluppo di molecole innovative in grado di curare malattie neurodegenerative e neuroinfiammatorie.
- 9 - Post genomica di leguminose foraggere
- 10 - Studio delle interazioni proteine-rame, proteine-proteine, proteine-acidi nucleici e proteine-lipidi a livello dei microdomini di membrana. Rilevanza per la comprensione delle "patologie da microdomini di membrana" come le malattie da prioni, la malattia di Alzheimer e le alterazioni del metabolismo lipidico.
Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Classificazione geografica
- Regione: Lombardia
Bibliografia
1 Bird AP, Wolffe AP (1999) Methylation-induced repression: belts, braces, and chromatin Cell 99:451-42 Wade PA (2001) Methyl CpG binding proteins: coupling chromatin architecture to gene regulation Oncogene 20:3166-73
3 Ehrlich KC (1993) Characterization of DBPm, a plant protein that binds to DNA containing 5-methylcytosine Biochim Biophys Acta 1172:108-16
4 Pitto L, Cernilogar F, Evangelista M, Lombardi L, Miarelli C, Rocchi P (2000) Characterization of carrot nuclear proteins that exhibit specific binding affinity towards conventional and non-conventional DNA methylation Plant Mol Biol 44:659-73
5 Finnegan EJ, Peacock WJ, Dennis ES (2000) DNA methylation, a key regulator of plant development and other processes Curr Op Gen Dev 10:217-223
6 Helin K (1998) Regulation of cell proliferation by the E2F transcription factors Curr Opin Genet Dev 8:28-35
7 Luo RX, Postino AA, Dean DC (1998) Rb interacts with histone deacetylase to repress transcription Cell 92:463-73
8 Robertson KD, Ait-Sit-Ali S, Yokochi T, Wade PA, Jones PL Wolffe AP (2000) DNMT1 forms a complex with Rb, E2F1 and HDCA1 and represses transcription from E2F-responsive promoters Nature Genet 25:338-342
9 Albani D, Mariconti L, Ricagno S, Pitto L, Moroni C, Helin K, Cella R (2000) DcE2F, a functional plant E2F-like transcriptional activator from D. carota J Biol Chem 275:19258-19267
10 Breviario D and Nick P. (2000) Review-article: Plant tubulins: a melting pot for basic questions and promising applications Trans Res 9:383-393
11 Cleveland, DW (1987) The multitubulin hyphotesis revisited: what have we learned? J Cell Biol 104:381-383
12 Goddard GH, Wick S. M., Silflow CD, Snustad DP (1994) Microtubule components of the plant cell cytoskeleton Plant Physiol 104:1-6
13 Villemur, R, Joyce CM, Haas NA, Goddard RH, Kopczak SD, HusseyPJ, Snustad DP, Silflow CD (1992) a-tubulin gene family of maize (Z. mays) J Mol Biol 227:81-96
14 Villemur, R, Haas, N.A., Joyce, C. M., Snustad, D.P. and Silflow, C.D. (1994) Characterization of four new b-tubulin genes and their expression during male flower development in maize (Z. mays) Plant Mol Biol 24:295-315
15 Kornberg RD, Lorch Y (1999) Twenty-five years of the nucleosome, fundamental particle of the eukaryotic chromosome Cell 98:285-294
16 Struhl K (1998) Histone acetylation and transcriptional regulatory mechanisms Genes Dev 12:599-606
17 Lusser A, Kolle D, Loidl P (2001) Histone acetylation: lesson from the plant kingdom Trends Plant Sci 6:59-65
18 Rossi V, Hartings H, Motto M (1998) Identification and characterisation of an RPD3 homologoue from maize (Z. mays L.) that is able to complement an rpd3 null mutant of S. cerevisiae Mol Gen Genet 258:288-296
19 Rossi V, Varotto S, Locatelli S, Lanzanova C, Lauria M, Zanotti E, Hartings H, Motto M (2001) The maize WD-repeat gene ZmRbAp1 encodes a member of the MSI/RbAp sub-family and is differentially expressed during endosperm development Mol Genet Genom 265:576-584
20 Herrick G, Seger, J (1999). Imprinting and paternal genome elimination in insects Results Probl Cell Differ 25:41-71
21 Sleutels F, Barlow DP, Lyle R (2000) The uniqueness of the imprinting mechanism Curr Opin Genet Dev. 10:229-233
22 Alleman M, Doctor J (2000) Genomic imprinting in plants: observations and evolutionary implications Plant Mol Biol 43:147-161
23 Lund G, Messing J, Viotti A (1995). Endosperm-specific demethylation and activation of specific alleles of -tubulin genes of Z. mays Mol Gen Genet 246:716-722
24 Lund G, Ciceri P, Viotti A (1995). Maternal-specific demethylation and expression of specific alleles of zein genes in the endosperm of Z. mays. Plant J 8:571-581
25 Yadegary R, Kinoshita T, Lotan O, Cohen G, Katz A, Choi Y, Nakashima K, Harada JJ, Goberg RB, Fisher RL, Ohad N (2000) Mutations of the FIE and Mea genes that interact polycomb proteins cause parent-oforigin effects on seed development by distinct mechanisms. Plant Cell 12:2367-2382
26 Sturaro M, Viotti A (2001). Methylation of the Opaque2 box in zein genes is parent-dependent and affects O2 DNA binding activity in vitro. Plant Mol Biol 46:549-560
27 Stevens FJ and Argon Y (1999) Protein folding in the ER. Semin Cell Devel Biol 10:443-454
28 Pedrazzini E, Giovinazzo G, Bielli A, de Virgilio M, Frigerio L, Pesca M, Faoro F, Bollini R, Ceriotti A, Vitale A (1997) Protein quality control along the route to the plant vacuole. Plant Cell 9:1869-1880
29 Ellgaard, L and Helenius, A (2001) ER quality control: towards an understanding at the molecular level Curr Opin Cell Biol 13, 431-437
30 Vitale A, Denecke J (1999) The endoplasmic reticulum - Gateway of the secretory pathway Plant Cell 11:615-628
31 Miernik JA (1999) Protein folding in the plant cell Plant Physiol 121:695-703
32 Gething M-J (1999) Role and regulation of the ER chaperone BiP. Semin Cell Devel Biol 10:465-472
33 Pedrazzini E, Giovinazzo G, Bollini R, Ceriotti A, Vitale A (1994) Binding of BiP to assembly-defective protein in plant cells. Plant J 5:103-110
34 Shewry PR and Tatam AS. (1997) Disulphide bonds in wheat gluten proteins J Cereal Sci 25, 207-227
35 Ferrari DM and Soling HD (1999) The protein disulphide-isomerase family: unravelling a string of folds. Biochem. J. 339: 1-10
36 Ciaffi M., Dominici L., Tanzarella O.A. and Porceddu E. (1999). Chromosomal assignement of gene sequences coding for protein disulphide isomerase (PDI) in wheat. Theor Appl Genet 98:405-410.
37 Ciaffi M, Paolacci A.R., Dominici L., Tanzarella O.A. and Porceddu E. (2001) Molecular characterization of gene sequences coding for protein disulfide isomerase (PDI) in durum wheat (T. turgidum ssp. durum). Gene 265:147-156
38 Galili G, Shimoni Y, Giorini-Silfen S, Levanony H, Altschuler Y, and Shani N (1996) Wheat storage proteins: assembly, transport and deposition in protein bodies Plant Physiol Biochem 34, 245-252
39 Wrigley C (1996) Giant proteins with flour power. Nature 381:738-739.
40 Payne PI, Nighttingale MA, Krattinger AF, Holt, LM (1987) The relationship between the HMW glutenin subunit composition and the bread-making quality of British grown wheat varieties J Sci Food Agric 38:51-65
41 Torrent M, Alvarez I, Geli MI, Dalcol I, Ludevid D (1997) Lysine-rich modified (-zein accumulates in protein bodies of transiently transformed maize endosperms Plant Mol Biol 34:139
42 Bagga S, Adams HP, Rodriguez FD, Kemp JD, Sengupta-Gopalan C (1997) Coexpression of the maize -zein and beta zein genes results in stable accumulation of -zein in endoplasmic reticulum-derived protein bodies formed by beta zein Plant Cell 9:1683-1696
43 Duranti M, Scarafoni A, Gius C, Negri A, Faoro F (1994) Heat-induced synthesis and tunicamycin-sensitive secretion of the putative storage glycoprotein conglutin gamma from mature lupin seeds Eur J Biochem 222:387-393
44 Scarafoni A, Di Cataldo A, Vassilevskaia TD, Bekman EP, Rodrigues-Pousada C, Ceciliani F, Duranti M (2001) Cloning, sequencing and expression in the seeds and radicles of two Lupinus albus g-conglutin genes Biochim Biophys Acta 1519:147-151
45 Kazutoshi M (2000) Tripartite management of unfolded proteins in the endoplasmic reticulum. Cell 101:451-454
46 Ng DTW, Spear ED, Walter P (2000) The unfolded protein respone regulates multiple aspects of secretory and membrane protein biogenesis and endoplasmic reticulum quality control J Biol Chem 150:77-88
47 Patil C, Walter P (2001) Intracellularsignaling from the endoplasmic reticulum to the nucleus: the unfoldede protein response in yeast and mammals Curr Op in Cell Biol 13:349-356
48 Travers KJ, Patil CK, Wodicka L, Lockhart DJ, Weissman JS, Walter P (2000) Functional and genomic analysis reveal an essential coordination between the unfolded protein response and ER-associated degradation Cell 101:249-258
49 Sparvoli F, Faoro F, Daminati M G, Ceriotti A, Bollini R (2000) Misfolding and aggregation of vacuolar glycoproteins in plant cells Plant J 24:825-836
Parole Chiave
Sequenze geni regolatrici di piante; Rimodellamento della cromatina; Attivatori e repressori trascrizionali; Proteine della via di secrezione; Modificazioni post-traduzionali di proteine vacuolari; Accumulo di proteine di alto valore biologicoESPRESSIONE GENICA ED ACCUMULO DI PROTEINE D'INTERESSE AGRONOMICO NELLA CELLULA VEGETALE: MECCANISMI TRASCRIZIONALI E
POST-TRASCRIZIONALI
Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR)
Abstract
La ricerca proposta si caratterizza per uno studio dettagliato e comprensvo di molti dei meccanismi che nelle piante controllano l'espressione genica, dalla trascrizione all'accumulo delle proteine. Questo obiettivo è pertinente con quello enunciato nel programma di studio di post-genomica laddove si richiede una maggiore comprensione dei meccanismi molecolari che influenzano l'espressione di importanti tratti agronomici. Questa proposta è finalizzata allo studio di quei meccanismi regolativi che integrandosi vicendevolmente co-operano nella produzione di proteine vegetali direttamente importanti per la nutrizione (proteine di riserva dei semi) o indirettamente importanti perchè influenzano la crescita della pianta (tubulina). Il piano di ricerca si sviluppa su due maggiori direttrici interconnesse tra loro e identificabili con il controllo trascrizionale e post-trascrizionale dei geni e dei loro prodotti.Studi a livello trascrizionale saranno condotti sui geni delle zeine con particolare attenzione a quei meccanismi epigenetici che sono associati al silenziamento genico e all'imprinting parentale. Sarà così valutato lo stato di metilazione delle regioni regolatrici dell'espressione dei geni zeinici come pure i cambiamenti nella struttura della cromatina che ne risultano. Questi studi si combineranno con quelli che intendono accertare il ruolo nella regolazione trascrizionale delle proteine che legano sequenze di DNA metilate (MBD) e delle istone deacetilasi >>>
Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
ANGELO VIOTTI, Consiglio nazionale delle ricerche (CNR)Obiettivo del Finanziamento
L'obiettivo principale dell'intera proposta è rappresentato dalla comprensione dei meccanismi che nelle piante controllano l'espressione dei geni sia a livello trascrizionale sia post-trascrizionale. Si intende così ricostruire la cascata di eventi regolativi che conducono alla produzione e all'accumulo di una proteina vegetale. Si tratta di un approccio chiaramente post-genomico poiché utilizza in buona parte geni e prodotti genici che sono già stati isolati e caratterizzati all'interno e al di fuori delle unità di ricerca. Su queste basi, uno dei principali obiettivi che lo sviluppo delle ricerche proposte intende raggiungere è quello della individuazione e della ricostruzione delle diverse interazioni tra proteine che caratterizzano tutti quei passaggi regolativi che portano dalla attivazione trascrizionale all'eventuale accumulo di una proteina.Da questo punto di vista il piano di ricerca proposto può essere articolato in due principali direttrici di indagine, comunque interconnesse tra loro. La prima direttrice di indagine riguarda lo studio di quei meccanismi che sono responsabili dell'attivazione e della repressione della trascrizione genica, con particolare attenzione a quei fenomeni di controllo epigenetico che sono rappresentati dalla metilazione del DNA e dal rimodellamento della cromatina in corrispondenza di zone trascrizionalmente attive. La seconda direttrice di indagine è focalizzata sui meccanismi che, una volta avvenuta la sintesi, controllano il>>>



