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PROGRAMMA DI RICERCA 2004
italiano - english
Unità di Ricerca
- Universita' degli Studi di CATANIA
SCIENZE MICROBIOLOGICHE E GINECOLOGICHE
CATANIA(CT) - Università degli Studi de L'AQUILA
SCIENZE E TECNOLOGIE BIOMEDICHE
L'AQUILA(AQ) - Università degli Studi INSUBRIA Varese-Como
SCIENZE CLINICHE E BIOLOGICHE
VARESE(VA) - Università degli Studi di PAVIA
SCIENZE MORFOLOGICHE EIDOLOGICHE E CLINICHE
PAVIA(PV) - Università degli Studi di GENOVA
SCIENZE CHIRURGICHE SPECIALISTICHE, DI ANESTESIOLOGIA E DEI TRAPIANTI D'ORGANO
GENOVA(GE)
Programmi di ricerca simili:
- 1 - Problemi emergenti di antibiotico-resistenza e virulenza in batteri patogeni Gram-positivi e Gram-negativi.
- 2 - Antibiotico-resistenza, virulenza e fitness in patogeni Gram-positivi e Gram-negativi.
- 3 - Una visione d'insieme sullo studio dei determinanti di resistenza e virulenza in batteri patogeni isolati in nosocomio ed in strutture extra-ospedaliere.
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- 8 - VALUTAZIONE DELLA PREVALENZA DEI CEPPI DI HIV-1 RESISTENTI NELLA POPOLAZIONE TRATTATA CON FARMACI ANTIRETROVIRALI E NELLE NUOVE DIAGNOSI. CREAZIONE DI UN DATABASE NAZIONALE PER LO STUDIO DEI DETERMINANTI DELLA RESISTENZA SECONDARIA E PRIMARIA AI FARMACI ANTIRETROVIRALI.
- 9 - Meccanismi molecolari di attività antimicrobica e di resistenza in microrganismi gram positivi
- 10 - PATOGENESI E TERAPIA DELLE MALATTIE DA INFEZIONE
Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze mediche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- HUMAN NECESSITIES
- FOODS OR FOODSTUFFS; THEIR TREATMENT, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- EDIBLE OILS OF FATS, e.g. MARGARINES, SHORTENINGS, COOKING OILS (animal feeding-stuffs A23K1/00; foods or foodstuffs containing edible oils or fats A21D, A23C, A23G, A23L; obtaining, refining, preserving C11B, C11C; hydrogenation C11C3/12)
- FOODS OR FOODSTUFFS; THEIR TREATMENT, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
Classificazione geografica
- Regione: Sicilia
Bibliografia
1. Cresti S, Lattanzi M, Zanchi A, Montagnani F, Pollini S, Cellesi C, Rossolini GM. Resistance determinants and clonal diversity in group A streptococci collected during a period of increasing macrolide resistance. Antimicrob Agents Chemother. 2002 Jun;46(6):1816-22.2. Farrell DJ, Douthwaite S, Morrissey, I., Bakker, S. Poehlsgaard J, Jakobsen L, and Felmingham D. (2003). Macrolide resistance by ribosomal mutation in clinical isolates of Streptococcus pneumoniae from the PROTEKT 1999/2000 study. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (in press).
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13. Riccio ML, Franceschini N, Boschi L, Caravelli B, Cornaglia G, Fontana R, Amicosante G, Rossolini GM. Characterization of the metallo-beta-lactamase determinant of Acinetobacter baumannii AC-54/97 reveals the existence of bla(IMP) allelic variants carried by gene cassettes of different phylogeny. Antimicrob Agents Chemother. 2000 May;44(5):1229-35.
14. Riccio ML, Franceschini N, Boschi L, Caravelli B, Cornaglia G, Fontana R, Amicosante G, Rossolini GM. Characterization of the metallo-beta-lactamase determinant of Acinetobacter baumannii AC-54/97 reveals the existence of bla(IMP) allelic variants carried by gene cassettes of different phylogeny. Antimicrob AgentsChemother. 2000 May;44(5):1229-35.
15. Riccio ML, Pallecchi L, Fontana R, Rossolini GM. In70 of plasmid pAX22, a bla(VIM-1)-containing integron carrying a new aminoglycoside phosphotransferase gene cassette. Antimicrob Agents Chemother. 2001 Apr;45(4):1249-53.
16. Baquero F, Baquero-Artigao G, Canton R, Garcia-Rey C. Antibiotic consumption and resistance selection in Streptococcus pneumoniae. J Antimicrob Chemother. 2002 Dec;50 Suppl C:27-38
17. Klein J, Lonks J, Metlay JP, Sahm D, Talbot GH. Clinical and public health implications of macrolide-resistant Streptococcus pneumoniae. J Chemother. 2002 Jul;14 Suppl 3:42-56. Review
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19. Martinez JL, Baquero F. Interactions among strategies associated with bacterial infection: pathogenicity, epidemicity, and antibiotic resistance. Clin Microbiol Rev. 2002 Oct;15(4):647-79
20. Perilli M, Segatore B, Massis MR, Franceschini N, Bianchi C, Rossolini GM, Amicosante G. Characterization of a new extended-spectrum beta-lactamase (TEM-87) isolated in Proteus mirabilis during an Italian survey. Antimicrob Agents Chemother. 2002 Mar;46(3):925-8.
21. van Belkum A (2000) “Molecular epidemiology of methicillin resistant Staphylococcus aureus strains: state of affairs and tomorrow’s possibilities. Microbial Drug Resist 6, 173-188.
22. van Belkum A, Hermans PW, Licciardello L, Stefani S, Grubb W, van Leeuwen W, Goessens WH. Polymerase chain reaction-mediated typing of microorganisms: tracking dissemination of genes and genomes. Electrophoresis. 1998 Apr;19(4):602-7.
23. van Belkum, Struelens M, Verbrugh H, Tibayrenc M (2001) “Role of genomic typing in taxonomy, evolutionary genetics and microbial typing.” ClinMicrobiol Rev
24. Zanelli G, Sansoni A, Zanchi A, Cresti S, Pollini S, Rossolini GM, Cellesi C. Staphylococcus aureus nasal carriage in the community: a survey from central Italy. Epidemiol Infect. 2002 Oct;129(2):417-20.25.
25. Stefania Stefani and Pietro E. Varaldo - Epidemiology of methicillin-resistant Staphylococci in Europe
Clinical Microbiol and Infection 2003; 9: 1179-1186
Parole Chiave
MECCANISMI DI RESISTENZA; GENI; MLST; ELEMENTI MOBILI; STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE; ENTEROBACTERIACEAE; STAPHYLOCOCCUS AUREUS MR; ALTRI GRAM-NEGATIVI; CLONALITA'Geni di resistenza nei microrganismi patogeni Gram-positivi e Gram-negativi: caratterizzazione molecolare, funzionale e loro trasferimento orizzontale.
Università degli Studi di CataniaAbstract
La nostra proposta di studio ha l'obiettivo principale di sviluppare le conoscenze dei meccanismi molecolari delle resistenze e della loro diffusione. Questo approccio è in parte alternativo a quello generalmente finanziato dalle industrie farmaceutiche, dove viene valutata esclusivamente la presenza di geni della resistenza ed eventualmente la loro epidemiologia. In questo studio verranno utilizzati approcci tecnologici molecolari e di genetica funzionale, inoltre verranno utilizzati strumenti piu' raffinati come la real Time PCR ed il sequenziamento per MLST. Il problema dell'antibiotico-resistenza, pur partendo da solide basi epidemiologiche, verrà studiato sia dal punto di vista dei geni, degli elementi mobili assieme agli aspetti di genetica di popolazione (la parte relativa alla diffusione;), sia alla caratterizzazione dei markers di resistenza (la parte relativa allo studio antimicrobico) in senso stretto.Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Giuseppe NICOLETTI Universita' degli Studi di CATANIAObiettivo del Programma di Ricerca
Questa proposta ha l'obiettivo di studiare: i) la caratterizzazione di geni della resistenza a livello molecolare e funzionale; ii) gli elementi genetici che veicolano questi geni; iii) la caratterizzazione della struttura di popolazioni dei patogeni resistenti. Mentre sono ben conosciuti molti meccanismi molecolari di resistenza, i meccanismi mediante i quali questi microrganismi diffondono sono molto meno conosciuti. Un approccio comprensivo a livello molecolare degli aspetti responsabili della mobilità degli elementi genetici che veicolano determinanti di resistenza, al di là degli aspetti epidemiologici, potrà provvedere un significativo avanzamento nel combattere i patogeni resistenti agli antibiotici, chiarendo la dinamica e i patterns di distribuzione dei vari elementi mobili. Studiare l'epidemiologia dei microrganismi resistenti nonché degli elementi mobili invece che soltanto dei geni, permetterà la scoperta di nuovi determinanti di resistenza.Obiettivi specifici del progetto:
Epidemiologia:
1) Screening di patogeni resistenti rilevanti dal punto di vista clinico e provenienti da diverse aree geografiche italiane; screening della localizzazione dei determinanti di resistenza .
2) Caratterizzazione dei geni e degli elementi genetici nei vari patogeni;
3) Identificazione dei ceppi a livello di specie e subspecie, mediante tests biochimici e molecolari
Analisi dei geni e degli elementi genetici:
4 >>>
Risultati parziali attesi
Nella prima parte del progetto, verrà definito il problema clinico ed epidemiologico delle resistenze. Gli isolati resistenti verranno caratterizzati a livello biochimico e molecolare. I background genetici ottenuti potranno consentire le prime analisi di genetica di popolazione.Verranno valutate le frequenze di trasferimento orizzontale di alcuni determinanti di resistenza in studio.Risultati e a spetti innovativi del progetto
Diversi aspetti della proposta possono mostrare tutto il loro potenziale di innovatività.
1) Studi di genetica di popolazione mettono in evidenza la diffusione della resistenza mediata da “cloni” o da “geni”;
2) Studio sugli elementi genetici e non soltanto sui geni che è certamente un metodo innovativo di studio delle resistenze.
3) Caratterizzazione dei determinanti di resistenza a livello molecolare e funzionale.
Durata
24 mesiBase di partenza scientifica nazionale o internazionale
La resistenza agli antibiotici rimane uno dei problemi clinici e di salute pubblica maggiori, nonostante la disponibilità di sempre nuovi potenti antibiotici. Di contro, i microrganismi, sottoposti alla loro pressione selettiva per più di 60 anni, hanno risposto con la diffusione di una progenie microbica non più sensibile alla loro azione. Diverse classi di antibiotici sono diventate, con l’andare del tempo, sempre meno efficaci proprio in relazione all’incremento di antibiotico-resistenza. Tra le resistenze emergenti più importanti e più preoccupanti, sono da annoverare quelle relative alla meticillino-resistenza negli stafilococchi, alla penicillina e ai macrolidi negli streptococchi, ai glicopeptidi negli enterococchi (e eventualmente la tanto temuta acquisizione di questa resistenza da parte degli stafilococchi) nonché a numerose altre classi di antibiotici quali aminoglucosidi, fluorochinoloni, cefalosporine di terza generazione e carbapenemici nelle Enterobacteriaceae, in Pseudomonas aeruginosa e in altri Gram-negativi quali Haemophilus influenzae.Oltre ai questi microrganismi, sono stati identificati nuovi patogeni opportunisti che posseggono patterns di resistenza multipli, quasi a dimostrare che l’acquisizione di determinanti di resistenza non sia altro che una sorta di “scalata” dallo stato di “non patogeno” a quello di “patogeno”. Questa osservazione diventa fortemente evidente nei pazienti >>>



