Contenuto
Ti trovi in: HOME »Programmi, progetti e risultati »I progetti »PRIN - Programmi di ricerca di Rilevante Interesse Nazionale»Programma di ricercaINIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE
PROGRAMMA DI RICERCA 2005
italiano - english
Unità di Ricerca
- Università degli Studi di ROMA "La Sapienza"
BIOLOGIA VEGETALE
ROMA(RM) - Università degli Studi ROMA TRE
BIOLOGIA
ROMA(RM) - Università degli Studi di LECCE
SCIENZE E TECNOLOGIE BIOLOGICHE ED AMBIENTALI
LECCE(LE) - Università degli Studi di ROMA "La Sapienza"
SCIENZE BIOCHIMICHE
ROMA(RM) - Università degli Studi di BOLOGNA
BIOLOGIA EVOLUZIONISTICA SPERIMENTALE
BOLOGNA(BO)
Programmi di ricerca simili:
- 1 - L'APOPLASTO E L'INTEGRAZIONE DI PROCESSI CHE REGOLANO LO SVILUPPO E L'IMMUNITÀ INNATA DELLE PIANTE
- 2 - Struttura e funzioni nella patogenesi di proteine non catalitiche prodotte da Funghi e Oomiceti fitopatogeni.
- 3 - Cerato-platanina: Struttura e relazioni strutturali con altre proteine fungine correlate, variazioni nell'espressione genica indotte in platano e potenzialità nell'indurre resistenza per il controllo del cancro colorato.
- 4 - Proteine di regolazione nelle piante: analisi biomolecolare dell'interazione di proteine 14-3-3 e calmodulina con proteine bersaglio.
- 5 - Regolazione della maturazione proteolitica del precursore del peptide beta-amiloide dell'Alzheimer
- 6 - Caratterizzazione molecolare dell'eritropoiesi:analisi post-genomica e funzionale del profilo di espressione proteica
- 7 - STRUTTURA, RUOLO FUNZIONALE E PROPRIETA' ANTIMICROBICHE DELLE CIANOVIRINE EUCARIOTICHE
- 8 - La rete di Interazioni fra proteine coniugate a Nedd8 o mono-ubiquitina ed i loro recettori
- 9 - Dallo studio dell’espressione genica globale allo studio della virulenza di Mycobacterium tuberculosis
- 10 - Fisiologia e patologia dell'assemblaggio, del traffico e del "signaling" di proteine nel reticolo endoplasmico
Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Classificazione geografica
- Regione: Lazio
Bibliografia
1) Aderem A, Levashina EA. Innate immunity. (2005) Curr Opin Immunol. 17, 1-3.2) Allan, A., C. and Fluhr R. (1997). Plant Cell, 9: 1559-1572.
3) Angelini R., Bragaloni M., Federico R., et al. (1993). J. Plant Physiol., 142: 704-709
4) Aravind L (2001). Trends Bioch Sci 26 : 524-526
5) Argon Y, Simen BB (1999). Semin Cell Dev Biol 10,495-505.
6) Assaad et al., 2004, Mol. Biol. Cell, 15:5118-5129
7) Aziz,S.M.,Yatin,M.,Worthen,D.R, et al.(1998) J. Pharm. Biomed. Anal., 17: 307 –320.
8) Broquet AH, Thomas G, Masliah J, et al. (2003) J Biol Chem. 278: 21601-612)
9) Brownlee C (2002). Curr Opin Plant Biol 5,396-401
10) Bonaldi T, Talamo F, et al. (2003) EMBO J 22,5551-5560
11) Coghlan, S.E. (1990). New Phytol., 116: 417-424.
12) Cohen SS (1998) A guide to the polyamines. Oxford University Press. New York.
13)Collins NC, Thordal-Christensen H, Lipka V, Bau S, et al. (2003). Nature 425,973-7
14) Cona A., Cenci F., Cervelli M., et al (2003). Plant Physiol., 131: 803-813.
15) Cullis,PM, Green RE, Merson-Davies L, Travis,N.1999. Chem. Biol., 6: 717 –729.
16)Dangl JL, Jones JDG (2001). Nature 411: 826-833
17) De Lorenzo G, D'Ovidio R, Cervone, F (2001). Annu Rev Phytopathol 39,313-335.
18) De Lorenzo G, Ferrari, S (2002). Curr Opin Plant Biol, 5,295-299.
19) Di Matteo A, Federici L, Mattei B, et al (2003). Proc Natl Acad Sci USA 100,10124-28.
20) Ferrari S, Vairo D, Ausubel FM, et al. (2003). Plant Cell 15, 93-106.
21) Feussner I, Wasternack C (2002). Ann Rev Plant Physiol Plant Mol Biol 53,275-297
22) Gomez-Gomez L. (2004) Mol Immunol. 41, 1055-62
23)Griesen D, Su D, Bérczi A, Asard H (2004). Plant Physiol 134: 726-734
24) Hammond-Kosack, K.E., Jones, J.D.J., 1996. Plant Cell. 8, 1773–1791
25) Hanton SL, Bortolotti LE, Renna L, Stefano G, Brandizzi F. (2005) Traffic. 2005 6:267-77.
26) Hara-Nishimura I, Matsushima R, Shimada T, Nishimura M. (2004) Plant Physiol. 136:3435-9.
27) Hawes C. (2005) New Phytol. 2005 165:29-44.
28) Hubert DA, Tornero P, Belkhadir Y, Krishna P, et al. (2003). EMBO J. 22,5679-89.
29) Hughes RC (1999) Biochim.Biophys.Acta 1473, 172-185
30) Ishiguro S, Watanabe Y, Ito N, Nonaka H et al. (2002). EMBO J 21,898-908.
31)Jelitto-Van Dooren EP, Vidal S, Denecke J (1999). Plant Cell 11,1935-1944.
32) Jurgens G. Annu Rev Cell Dev Biol. 2004;20:481
33)Keller T, Damude HG, Werner D, Doerner P, Dixon RA, Lamb C (1998). Plant Cell 10: 255-266
34)Kistner C, Parniske, M (2002). Trends Plant Sci 7,511-518.
35)Lamb C, Dixon RA (1997). Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol 48: 251-275
36)Laurenzi M., Rea G., Federico R., Tavladoraki P., Angelini R (1999). Planta, 208:146-154
37)Leister RT, Dahlbeck D., Day B. et al. (2005) The Plant Cell, 17, 1268–1278
38) Lu R, Malcuit I, Moffett P, et al. (2003). EMBO J 22,5690-9.
39)Moller SG, McPherson MJ (1998). Plant J., 13:781-91.
40) Neuteboom LW, Ng JM, Kuyper M, et al (1999) Plant Mol Biol 39, 273-287
41)Nuhse TS, Boller T, Peck SC. (2003) J Biol Chem. 278:45248-54
42) Nurnberger T, Brunner F, ET AL. (2004). Immunol. Rev. 198, 249-266
43) Philpott DJ, Stephen E. Girardin (2004) Molecular Immunology 41 1099–1108
44) Pignocchi C and Foyer CH (2003). Curr Opin Plant Biol 6: 379-389
45)Pimpl P, Denecke J. Plant Mol Biol. 2002 Dec;50(6):887-902.
46) Pratelli J, Sutter J-U and Blatt RM (2004) Trends in Plant Science 9, 187-195
47) Preger V, Scagliarini S, Pupillo P, Trost P (2005) Planta, 220: 365-375
48)Rea G., Metoui O., Infantino A., Federico R. and Angelini R. (2002)., 128: 865-875.
49)Reiter WD. (2002). Curr Opin Plant Biol. 5, 536-42.
50)Ridley BL, O'Neill MA, Mohnen D. (2001 Phytochemistry 57,929-67.
51) Sangster TA, Queitsch C. (2005) Curr Opin Plant Biol.8:86-92
52)Schirozu M et al. (1996). Genomics 37: 273-280
53)Schulze-Lefert P (2004 Curr Opin Plant Biol. 7:377-83
54)Sicilia F, Mattei B, Cervone F, ET AL. (2005). Biochim Biophys Acta. 1748:9-19.
55)Soulet D., Covassin L. Kaouass M., ET AL (2002). Biochem. J., 367: 347-357.
56) Tachihara K., Uemura T., Kashiwagi K., Igarashi K. (2005) J. Biol. Chem. 280: 12637-42.
57)Trost P, Bérczi A, Sparla F, et al (2000). Biochim Biophys Acta 1468: 1-5
58)Tsubaki M, Nakayama M, Okuyama E, et al (1997). J Biol Chem 272: 23206-23210
59)Vargas JD, Herpes B, McKie AT, et al (2003). Biochim Biophys Acta 1651: 116-123
60)Vitale A (2001). Plant Cell 13, 1260-1262.
61)Vitale A, Denecke J (1999). Plant Cell 11, 615-628.
62)Walters DR.( 2003). Phytochemistry, 64: 97-107
63)Wewers MD (2004) PNAS 101, 10241–10242
REFERENCES CITED IN THE RESEARCH PROGRAMME
1) Dunckley TPJ, Watson R, Griffin Jl, Dupree P and Lilley KS (2004) Molecular &Cellular Proteomics 3:1128-1134
2) Dunckley TPJ, Watson R, Griffin Jl, Dupree P and Lilley KS (2004) Biochemical Society Transactions 32, 520-523.
3) Flury T, Wagner E, Kreuz K (1996). Plant Phisiol 112(3):1185-1190
4) Lu R, Malcuit I, Moffet P, Ruiz MT, Peart J, Wu AJ, Rathjen JP, Bendahmane A, Day L, Baulcombe DC (2003). EMBO J 22, 5690-9
5) Pedrazzini E, Giovinazzo G, Bielli A, de Virgilio M, Frigerio L, Pesca M, Faoro F, Bollini R, Ceriotti A, Vitale A (1997). Plant Cell 9, 1869-1880.
Parole Chiave
INTERAZIONI PROTEINA-PROTEINA; PROTEINE LRR; TRAFFICO VESCICOLARE; PROFILI MOLECOLARI ASSOCIATI AI PATOGENI (PAMP); STATO REDOX; PARETE CELLULARE; POLIAMMINE; RISPOSTA DI DIFESA; MATRICE EXTRACELLULAREIl "milieu" extracitoplasmatico: la prima linea di difesa nell'immunità innata delle piante
Università degli Studi di Roma "La Sapienza"Abstract
L'apoplasto è la prima linea di difesa contro gli organismi patogeni e gli erbivori. Le piante si basano, per la difesa, su un sistema definito di "immunità innata", i cui principali elementi sono i recettori PRR (recettori codificati dalla linea germinale). Questi interagiscono con elicitori rilasciati dai patogeni che possono essere pianta-genotipo specifici (fattori di avirulenza) o elicitori di tipo non-specifico (PAMP: pattern molecolari associati a patogeni). Molti PRR sono proteine con domini ricchi in leucina (LRR) extracitoplasmatici. L'attivazione del sistema immunitario innato da parte dei PRR innesca una risposta di difesa multicomponente che include alterazioni dell'omeostasi dell'apoplasto. Il cambiamento dello stato redox dell'apoplasto è una delle risposte più precoci. Cambiamenti nella composizione dell'apoplasto coinvolgono la secrezione di molte proteine e molecole correlate alla difesa e cambiamenti delle proteine della membrana plasmatica. Quindi, la regolazione dell'ambiente apoplastico nella difesa è strettamente legata al traffico delle vescicole che si originano dal Golgi e alla loro composizione.In questo progetto, 5 unità di ricerca condivideranno le conoscenze avanzate e l'esperienza maturata in biochimica, proteomica, biologia molecolare, genetica molecolare, "imaging" in vivo, biologia strutturale e bioinformatica per studiare:
1) Il riconoscimento mediato da proteine con domini di interazione extracitoplasmatici. Saranno >>>
Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Giulia DE LORENZO Università degli Studi di ROMA "La Sapienza"Obiettivo del Programma di Ricerca
Il nostro obiettivo primario è di chiarire quegli eventi complessi che avvengono nell'apoplasto e che determinano la capacità di una pianta di resistere ai patogeni. L'apoplasto è la prima linea di difesa contro patogeni ed erbivori e possiede un sistema di sorveglianza sofisticato per rilevare l'attacco di un patogeno. Il sistema è a sua volta connesso con le vie di segnalazione citoplasmatiche che portano all'attivazione di risposte multivalenti di difesa. Il sistema di difesa comprende alterazioni dell'omeostasi apoplastica laddove variazioni dello stato redox e delle proteine secrete e di membrana sono fondamentali. I meccanismi messi in moto compongono quel sistema definito di "immunità innata" che protegge le piante da funghi, batteri e virus. Il riconoscimento di (macro)molecole comuni a diversi patogeni (pathogen-associated molecular patterns=PAMPs) da parte di specifici recettori della pianta è l'evento chiave del sistema. Recettori chinasici con domini extracellulari formati da moduli ricchi in leucina (LRR) e specializzati nelle interazioni proteina-proteina sono alla base del riconoscimento dei PAMPs.Di questi recettori non c'è alcuna informazione riguardante la base strutturale della loro funzione di riconoscimento. Inoltre, se da una parte la segnalazione e le risposte di difesa interne alla cellula sono oggetto di intensi studi, poche sono le informazioni riguardanti gli eventi apoplastici a livello molecolare e la loro rilevanza per la difesa. il >>>
Durata
24 mesiBase di partenza scientifica nazionale o internazionale
Questo programma viene riproposto dopo una revisione. Nella valutazione precedente era stato valutato positivamente ma non era stato finanziato per la limitazione dei fondi disponibili: la differenza nello scarto con l'ultimo progetto finanziato era molto bassa. I commenti dei revisori sono stati considerati e le osservazioni sono state accolte per migliorarlo. L'attenzione è adesso concentrata sull'immunità innata e sono stati inclusi (includendo una quinta UR) studi sulle basi strutturali del riconoscimento molecolare che è un evento cruciale in questo fenomeno. Gli approcci medodologici per affrontare lo studio del traffico delle macromolecole sono stati ampliati, e anche le competenze, data l'esperienza in biologia strutturale e bioinformatica della nuova UR. Questa competenza è stategica per l'attuazione del lavoro di frontiera previsto in questo progetto.Verranno considerati due principali aspetti del ruolo del "milieu" apoplastico vegetale nell'immunità innata
A) Le interazioni proteina-proteina per il riconoscimento nel milieu apoplastico;
B) La regolazione dello stato e della composizione del milieu apoplastico in risposta a due PAMP: gli OG e flg22.
INTRODUZIONE
L'apoplasto, rappresentato principalmente dalla parete cellulare, ha funzioni strutturali, di regolazione della crescita e di comunicazione cellula-cellula (9,49). Essendo il compartimento cellulare che direttamente si affaccia sull'ambiente esterno, esso >>>



