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PROGRAMMA DI RICERCA 2005
italiano - english
Unità di Ricerca
Programmi di ricerca simili:
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Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- PHYSICS
- MEASURING (counting G06M); TESTING
- INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES (separating components of materials in general B01D, B01J, B03, B07; apparatus fully provided for in a single other subclass, see the relevant subclass e.g. B01L; measuring or testing processes other than immunoassay, involving enzymes or micro-organisms C12M, C12Q; investigation of foundation soil in situ E02D1/00; sensing humidity changes for compensating measurements of other variables or for compensating readings of instruments for variations in humidity, see G01D or the relevant subclass for the variable measured; testing or determining the properties of structures G01M; measuring or investigating electric or magnetic properties of materials G01R; systems or methods in general, using reception or emission of radiowaves or other waves and based on propagation effects, e.g. Doppler effect, propagation time, direction of propagation, G01S; determining sensivity, graininess, or density of photographic materials G03C5/02; testing component parts of nuclear reactors G21C17/00; [N: controlling or regulating non-electric variables G05D; measuring degree of ionisation of ionised gases, i.e. plasma H05H1/00A; testing electrographic developer properties G03G15/08H6])
- MEASURING (counting G06M); TESTING
Classificazione geografica
- Regione: Lombardia
Bibliografia
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Parole Chiave
GENETICA; CROMOSOMA Y UMANO; DNA MITOCONDRIALE UMANO; POLIMORFISMI DEL CROMOSOMA Y; POLIMORFISMI DEL DNA MITOCONDRIALE; STUDI DI ASSOCIAZIONE CON PATOLOGIE; VARIABILITÀ GENETICA UMANA; APLOGRUPPI; ANALISI FILOGENETICALa dissezione molecolare delle filogenesi del cromosoma Y e del DNA mitocondriale: un requisito essenziale per gli studi di associazione con patologie complesse
Università degli Studi di PaviaAbstract
Nell'ultima decade, numerosi studi, a cui abbiamo contribuito, hanno utilizzato gli aplogruppi del DNA mitocondriale (mtDNA) e della porzione maschio-specifica (MSY) del cromosoma Y per studiare l'origine e l'evoluzione di popolazioni umane. Bisogna ricordare, però, che l'mtDNA e l'MSY non sono solamente due porzioni di DNA con caratteristiche peculiari che li rendono particolarmente informativi negli studi evolutivi. Essi contengono geni con funzioni cellulari molto importanti, e la loro variazione di sequenza è stata associata ad una vasta gamma di malattie e fenotipi. Gran parte di queste associazioni sono però tuttora provvisorie. I risultati di uno studio in una popolazione spesso non sono stati confermati in altre, o addirittura sono state pubblicate conclusioni discordanti.Gli studi di associazione con patologie e disordini complessi sono complicati da vari fattori, tuttavia il limite maggiore di quelli riguardanti l'mtDNA e la regione MSY consiste nella scarsa risoluzione degli aplogruppi nelle rispettive filogenesi. Finora gli aplogruppi sono stati definiti sulla base di ramificazioni molto profonde nell'albero; in altre parole sono caratterizzati da polimorfismi molto antichi, quindi negli studi di associazione è stata ignorata gran parte della variabilità più recente.
Questa situazione ha un costo notevole per la ricerca biomedica, che spesso produce risultati non conclusivi e può essere risolta solo sviluppando un nuovo strumento >>>
Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Antonio TORRONI Università degli Studi di PAVIAObiettivo del Programma di Ricerca
L'mtDNA e la porzione maschio-specifica (MSY) del cromosoma Y non ricombinano alla meiosi, pertanto il loro differenziamento è avvenuto solo per accumulo sequenziale di nuove mutazioni lungo linee di radiazione rispettivamente materna e paterna. Nel tempo, questo processo di differenziazione molecolare ha dato origine ad unità monofiletiche che sono chiamate aplogruppi. Poiché questa differenziazione molecolare è avvenuta principalmente durante e dopo il processo di colonizzazione umana delle varie regioni e continenti, gli aplogruppi e i sottoaplogruppi tendono ad essere limitati a specifiche aree geografiche e gruppi di popolazioni. Nell'ultima decade, numerosi studi, a cui abbiamo contribuito, hanno utilizzato gli aplogruppi di questi due sistemi genetici per studiare l'origine e l'evoluzione di popolazioni umane. Bisogna ricordare, però, che l'mtDNA e l'MSY non sono solamente due porzioni di DNA con caratteristiche peculiari che li rendono particolarmente informativi negli studi evolutivi. Essi contengono geni con funzioni cellulari molto importanti, e la loro variazione di sequenza è stata associata ad una vasta gamma di malattie e fenotipi. Gran parte di queste associazioni sono però tuttora provvisorie. I risultati di uno studio in una popolazione spesso non sono stati confermati in altre, o addirittura sono state pubblicate conclusioni discordanti.Gli studi di associazione con patologie e disordini complessi sono complicati da vari fattori, tuttavia >>>
Durata
24 mesiBase di partenza scientifica nazionale o internazionale
Per maggiore chiarezza, nonché per ragioni di spazio, le sezioni riguardanti rispettivamente l'mtDNA ed il cromosoma Y saranno trattate separatamente. Per quanto riguarda l'mtDNA il nostro intento è quello di analizzare in dettaglio la parte della filogenesi che comprende gli aplogruppi tipici delle popolazioni europee. La necessità di avere dati chiari su questi aplogruppi è giustificata dal fatto che questi più di altri, sono stati oggetto di numerosi studi e associati a patologie complesse. Per quanto riguarda il cromosoma Y, l'obiettivo è quello di aumentare il livello di risoluzione di TUTTI gli aplogruppi principali della filogenesi mondiale.GLI STUDI DI ASSOCIAZIONE CON GLI APLOGRUPPI DELL'MTDNA IN EUROPA
Il genoma mitocondriale (16.569 paia di basi) è trasmesso per via materna. In aggiunta presenta un alto tasso evolutivo 10-20 volte più elevato di quello dei geni nucleari e non ricombina alla meiosi; esso rappresenta perciò un registro molecolare della storia delle donne che lo hanno trasmesso nelle varie generazioni. Bisogna ricordare, però, che, con l'eccezione della regione di controllo di circa 1.1 kb, l'intero mtDNA è codificante. Contiene 13 geni che codificano per subunità essenziali della catena respiratoria e 24 geni che codificano per gli RNA necessari per una corretta sintesi proteica all'interno del mitocondrio stesso. Poiché i mitocondri producono l'energia cellulare sotto forma di ATP grazie al processo di fosforilazione >>>



