Vai al contenuto| Home page|

   Ti trovi in: HOME »Programmi, progetti e risultati »I progetti »PRIN - Programmi di ricerca di Rilevante Interesse Nazionale»Programma di ricerca
INIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE

PROGRAMMA DI RICERCA 2005

italiano - english
Unità di Ricerca
Programmi di ricerca simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
  • CHEMISTRY; METALLURGY
    • BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
      • MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
Classificazione geografica
Bibliografia
Brydon, E.W., Smith, H., Sweet, C., 2003. Influenza A virus-induced apoptosis in bronchiolar epithelial (NCI-H292) cells limits pro-inflammatory cytokine release. J. Gen. Virol. 84, 2389-2400.

Clarke, P., Tyler, K.L., 2003. Reovirus-induced apoptosis. A minireview. Apoptosis. 8, 141-150.

Cohen, J.J., Duke, R.C., 1992, Apoptosis and programmed cell death in immunity. Annu. Rev. Immunol. 10, 267-293.

de Groot, R.J., Maduro, J., Lenstra, J.A., Horzinek, M.C., van Der Ziejst, B.A.M., Spaan, W.J.M., 1987. cDNA cloning and sequence analysis of the gene encoding the peplomer protein of feline infectious peritonitis virus. J. Gen. Virol. 68, 2639-2646.

De Martino, L., Marfè, G., Di Stefano, C., Pagnini, U., Florio, S., Crispino, L., Iovane, G., Macaluso, M., Giordano, A., 2003. Interference of bovine herpesvirus 1 (BHV-1) in sorbitol-induced apoptosis. J. Cell. Biochem. 89, 373-380.

Dolja, V.V., Carrington, J.C., 1992. Evolution of positive-strand RNA viruses. Semin. Virol. 3, 315-326.

Enjuanes, L., Brian, D., Cavanagh,, D., Holmes, K., Lai, M.M.C., Laude, H., Masters, P., Rottier, P., Siddell, S., Spaan, W.J.M., Taguchi, F., Talbot, P., 2000. Coronaviridae. In: van Regenmortel, M.H.V., Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L., Carstens, E.B., Estes, M.K., Lemon, S.M., Maniloff, J., Mayo, M.A., McGeoch, D.J., Pringle, C.R., Wickner, R.B. (Eds.), Virus Taxonomy, Classification and Nomenclature of Viruses. Academic Press, New York, pp.835-849.

Hanon, E., Lambot, M., Hoorneart, S., Lyaku, J., Pastoret, P.P., 1998a. Bovine herpes virus 1-induced apoptosis: phenotypic characterization of susceptible peripheral blood mononuclear cells. Arch. Virol. 143, 441-452.

Herbein, G., Van Lint, C., Lovett, J.L., Verdin, E., 1998. Distinct mechanisms trigger apoptosis in human immunodeficiency virus type 1-infected and in uninfectedbystander T lymphocytes. J. Virol. 72, 660-670.

Hofmann, J., Pletz, M.W., Liebert, U.G., 1999. Rubella virus-induced cytopathic effect in vitro is caused by apoptosis. J. Gen. Virol. 80, 1657-1664.

Hohdatsu, T., Okada, S., Ishizuka, Y., Yamada, H., Koyama, H., 1992. The prevalence of types I and II feline coronavirus infections in cats. J. Vet. Med. Sci. 54, 557-562.

Ikeda, Y., Shinozuka, J., Miyazawa, T., Kurosawa, K., Izumiya, Y., Nishimura, Y., Nakamura, K., Cai, J., Fujita, K., Doi, K., Mikami, T., 1998. J. Virol. 72, 6932-6936.

Jarvis, T.C., Kirkegaard, K., 1991. The polymerase in its labyrinth: mechanisms and implications of RNA recombination. Trends Genet. 7, 186-191.

Jia, W., Karaka, K., Parrish, C.R., Naqi, S.A., 1995. A novel variant of infectious bronchitis virus resulting from recombination among three different strains. Arch. Virol. 140, 259-271.

Kang, J.I., Park, S.H., Lee, P.W., Ahn, B.Y., 1999. Apoptosis is induced by hantaviruses in cultured cells. Virology 264, 99-105.

Keck, J.G., Matsushima, G.K., Makino, S., Fleming, J.O., Vannier, D.M., Stohlman, S.A., Lai, M.M.C., 1988. In vivo RNA-RNA recombination of coronavirus in mouse brain. J. Virol. 62, 1810-1813.

Kerr, J.F.R., Harmon, B.V., 1991. Definition and incidence of apoptosis: an historical perspective. In: Apoptosis: the molecular basis of cell death, Tomei L.D. and Cope F.O. Eds, New York, Cold Spring Harbor Laboratory Press, pp. 5-29.

Kieff, E., Shenk, T., 1998. Modulation of apoptosis by herpesviruses. Semin. Virol. 8, 471-480.

Kirkegaard, K., Baltimore, D., 1986. The mechanism of RNA recombination in poliovirus. Cell 47, 433-443.

Kottier, S.A., Cavanagh, D., Britton, P., 1995. Experimental evidence of recombination in coronavirus infectious bronchitis virus. Virology 213, 569-580.

Koyama, A.H., Arakawa, T., Adachi, A., 2000. Characterization of apoptosis induced by sorbitol: A unique system for the detection of antiapoptotic activities of viruses. Microbes Infect. 2, 599-606.

Kuo, L., Godeke, G.J., Raamsman, M.J., Masters, P.S., Rottier, P.J., 2000. Retargeting of coronavirus by substitution of the spike glycoprotein ectodomain: crossing the host cell species barrier. J. Virol. 74, 1393-1406.

Kyprianou, N., Isaacs, J.T., 1988. Activation of programmed cell death in the rat ventral prostate after castration. Endocrinology 122, 522-529.

Lai, M.M.C., Baric, R.S., Makino, S., Keck, J.G., Egbert, J., Leibowitz, J.L., Stohlman, S.A.. 1985. Recombination between nonsegmented RNA genomes of murine coronaviruses. J. Virol. 56, 449-456.

Liu, C., Xu, H.Y., Liu, D.X., 2001. Induction of caspase-dependent apoptosis in cultured cells by the avian coronavirus infectious bronchitis virus. J. Virol. 75, 6402-6409.

Lynch, M.P., Nawaz, S., Gerschenson, L.E., 1986. Evidence for soluble factors regulation cell death and cell proliferation in primary cultures of rabbit endometrial cells grown on collagen. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 4784-4790.

Makino, S., Keck, J.G., Stohlman, S.A., Lai, M.M.C., 1986. High-frequency RNA recombination of murine coronavirus. J. Virol. 57, 729-739.

Mori, I., Komatsu, T., Takeuchi, K., Nakakuki, K., Sudo, M., Kimura, Y., 1995. In vivo induction of apoptosis by influena virus. J. Gen. Virol. 76, 2869-2873.

Motokawa, K., Hohdatsu, T., Hashimoto, H., Koyama, H., 1996. Comparison of the amino acid sequence and phylogenetic analysis of the peplomer, integral membrane and nucleocapsid proteins of feline canine and porcine coronaviruses. Microbiol. Immunol. 40, 425-433.

Naruse, I., Keino, H., 1995. Apoptosis in the developing CNS. Prog. Neurobiol. 47, 135-155.

Oura, C.A., Powell, P.P., Parkhouse, R.M., 1998. Africa swine fever: a disease characterized by apoptosis. J. gen. Virol. 79, 1427-1438.

Pagnini, U., Montagnaro, S., Sanfelice di Monteforte, E., Pacelli, F., De Martino, L., Roperto, S., Florio, S., Iovane G., 2005. Caprine herpesvirus-1 (CapHV-1) induces apoptosis in goat peripheral blood mononuclear cells. Vet. Immun. Immunopathol. 103, 283-293.

Pratelli, A., Elia, G., Martella, V., Tinelli, A., Decaro, N., Marsilio, F., Buonavoglia, D., Tempesta, M., Buonavoglia, C., 2002. M gene evolution of canine coronavirus in naturally infected dogs. Vet. Rec. 151, 758-761.

Pratelli, A., Martella, V., Elia, G., Decaro, N., Aliberti, A., Buonavoglia., D., Tempesta, M., Buonavoglia, C., 2001. Variation of the sequence in the gene encoding for transmembrane protein M of canine coronavirus (CCV). Mol. Cell. Probes 15, 229-233.

Pratelli, A., Martella, V., Pistello, M., Elia, G., Decaro, N., Buonavoglia, D., Camero, M., Tempesta, M., Buonavoglia, C., 2003a. Identification of coronaviruses in dogs that segregate separately from the canine coronavirus genotype. J. Virol. Methods 107, 213-222.

Pratelli, A., Martella, V., Decaro, N., Tinelli, A., Camero, M., Cirone, F., Elia, G., Cavalli, A., Corrente, M., Greco, G., Buonavoglia, D., Gentile, M., Tempesta, M., Buonavoglia, C., 2003b. Genetic diversity of a canine coronavirus detected in pups with diarrhoea in Italy. J. Virol. Methods 110, 9-17.


Sanchez, C.M., Izeta, A., Sanchez-Morgado, J.M., Alonso, S., Sola, I., Balasch, M., Plana-Duran, J., Enjuanes, L., 1999. Targeted recombination demonstrates that the spike gene of transmissible gastroenteritis coronavirus is a determinant of its enteric tropism and virulence. J. Virol. 73, 7607-7618.

Tschopp, J., Thome, M., Hofmann, K., Meinl, E., 1998. The fight of viruses against apoptosis. Curr. Opin. Genet. Dev. 8, 82-87.

Vennema, H., Poland, A., Floyd Hawkins, K., Pedersen, N.C., 1995. A comparison of the genomes of FECVs and FIPVs and what they tell us about the relationships between felinecoronaviruses and their evolution. Feline Pract. 23, 40-44.

Wang, L., Junker, D., Collisson, E.W., 1993. Evidence of natural recombination within the S1 gene of infectious bronchitis virus. Virology 192, 710-716.

Wyllie, A., 1998. Apoptosis. An endonuclease at last. Nature 391, 20-21.

Yan, H., Xiao, G., Zhang, J., Hu, Y., Yuan, F., Cole, D.H., Zheng, C., Gao, G.F., 2004. SARS coronavirus induces apoptosis in Vero E6 cells. J. Med. Virol. 73, 323-331.
Parole Chiave
CANE; CORONAVIRUS; ORF3; ESPRESSIONE IN VITRO; ESPRESSIONE IN VIVO; EFFETTO CITOPATICO; APOPTOSI; CASPASI; GENI APOPTOTICI

IL CORONAVIRUS DEL CANE: ASPETTI MOLECOLARI E PATOGENETICI

Università degli Studi di Bari
Abstract
L'emergenza SARS ha suscitato un notevole interesse nella comunità scientifica internazionale per quanto riguarda i coronavirus animali, che possono essere presi a modello della infezione sostenuta dal coronavirus della SARS (SARS-CoV).
Il progetto di ricerca prende in considerazione il coronavirus del cane (CCoV), responsabile di enterite nei cuccioli di alcuni mesi di età. Di questo virus sono stati identificati recentemente due distinti genotipi: CCoV tipo II che è facilmente adattabile alla crescita in vitro, e CCoV tipo I, che non è stato mai isolato su colture cellulari. L'analisi di estese regioni del genoma virale ha evidenziato una notevole correlazione genetica tra CCoV tipo I ed il coronavirus felino tipo I (FCoV tipo I), che analogamente presenta delle difficoltà di addattamento alla crescita in vitro.
La ricerca riguarderà aspetti sia molecolari che patogenetici. Per quanto riguarda gli aspetti molecolari, sarà studiata la proteina codificata dal gene ORF3, recentemente identificato nel genoma di CCoV tipo I. Tale gene è esclusivo di CCoV tipo I, in quanto non è presente nel genoma di CCoV tipo II, nè in quello di altri coronavirus o organismi conosciuti. Tale proteina sarà espressa in sistemi eucariotici sia in vitro, mediante reticolociti di coniglio, sia in vivo, mediante sistema vaccinia virus.
Per quanto riguarda gli aspetti patogenetici, sarà valutata l'attività apoptotica di CCoV (in particolare del genotipo II, che è l'unico che >>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Nicola DECARO Università degli Studi di BARI
Obiettivo del Programma di Ricerca
Il progetto di ricerca presenta due obiettivi principali:
1. Caratterizzare la proteina codificata dal gene accessorio ORF3, recentemente identificato nel genoma di CCoV tipo I, mediante studi di espressione in vitro (sistema reticolociti di coniglio) ed in vivo (sistema vaccinia virus). In questo modo sarà possibile comprendere le caratteristiche biochimiche e funzionali di tale proteina, le quali saranno confrontate con quelle di proteine codificate da geni accessori di altri coronavirus, tra cui SARS-CoV.
2. Valutare l'attività apoptotica di CCoV tipo II (unico genotipo di CCoV finora adattato alla crescita in vitro), con particolare riferimento all'eventuale coinvolgimento nei meccanismi apoptotici delle caspasi, enzimi proteolitici per i quali è stato dimostrato un ruolo essenziale nell'induzione della apoptosi. I risultati ottenuti potranno fornire indicazioni sui probabili meccanismi apoptotici coinvolti nella infezione sostenuta da SARS-CoV.

Durata
24 mesi
Base di partenza scientifica nazionale o internazionale
Il coronavirus del cane (CCoV) appartiene alla famiglia Coronaviridae ed è un virus provvisto di envelope, con RNA monocatenario a polarità positiva, che causa enteriti di forma lieve o grave nei cuccioli. CCoV fa parte dei coronavirus di gruppo I, insieme al virus della gastroenterite trasmissibile del suino (TGEV), al virus della diarrea epidemica del suino (PEDV), al coronavirus respiratorio del suino (PRCoV), ai coronavirus felini (FCoV) ed al coronavirus umano 229E (HCoV 229E). Circa due terzi dell'RNA genomico sono costituiti da due grandi open reading frames (ORF), parzialmente sovrapposte, designate ORF1a e ORF1b, che codificano per due poliproteine le quali danno origine alla replicasi virale. La porzione 3' del genoma comprende altre ORF che codificano per proteine strutturali e non strutturali. Le proteine strutturali sono le proteine S, E, M ed N, che sono sintetizzate rispettivamente a partire dalle ORF 2, 4, 5 e 6 (Enjuanes et al., 2000).
Uno degli aspetti più importanti della replicazione dei coronavirus è rappresentato dalla elevata frequenza di ricombinazioni omologhe dell'RNA (Kirkegaard & Baltimore, 1986; Lai et al., 1985; Makino et al., 1986), che si ritiene essere mediato da un meccanismo "copy-choice" (Makino et al., 1986). Fenomeni di ricombinazione del genoma dei coronavirus sono stati osservati nelle tessuto-colture infette (Lai et al., 1985; Makino et al., 1986; Sanchez et al., 1999; Kuo et al., 2000), negli animali infettati >>>