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PROGRAMMA DI RICERCA 2006
italiano - english
Unità di Ricerca
Programmi di ricerca simili:
- 1 - Struttura, funzione e biogenesi dei trasportatori mitocondriali per metaboliti
- 2 - Ricostituzione in liposomi di sistemi di trasporto di membrana plasmatica per la glutammina ed altri amminoacidi: un modello sperimentale per lo studio della funzione e della regolazione di proteine native ed over-espresse.
- 3 - Caratterizzazione strutturale e funzionale del trasportatore umano degli amminoacidi eccitatori di tipo 2 (EAAT2) e della sua interazione con nuovi ligandi di interesse farmaceutico
- 4 - Supramolecular complexes of sorcin in the generation and regulation of Calcium-dependent cellular functions
- 5 - Proprieta’ strutturali e attivita’ funzionale di un complesso proteico modificante la cromatina nell’uomo
- 6 - Caratterizzazione molecolare dell'eritropoiesi:analisi post-genomica e funzionale del profilo di espressione proteica
- 7 - Identificazione di nuovi trasportatori mitocondriali nell'uomo
- 8 - Dallo studio dell’espressione genica globale allo studio della virulenza di Mycobacterium tuberculosis
- 9 - Individuazione di determinanti di folding e misfolding mediante mutagenesi sistematica
- 10 - Fisiologia e patologia dell'assemblaggio, del traffico e del "signaling" di proteine nel reticolo endoplasmico
Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- ORGANIC CHEMISTRY (such compounds as the oxides, sulfides, or oxysulfides of carbon, cyanogen, phosgene, hydrocyanic acid or salts thereof C01; products obtained from layered base-exchange silicates by ion-exchange with organic compounds such as ammonium, phosphonium or sulfonium compounds or by intercalation of organic compounds C01B33/44; macromolecular compounds C08; dyes C09; fermentation products C12; fermentation or enzyme-using processes to synthesise a desired chemical compound or composition or to separate optical isomers from a racemic mixture C12P; production of organic compounds by electrolysis or electrophoresis C25B3/00, C25B7/00)
- PEPTIDES (peptides in foodstuffs A23; obtaining protein compositions for foodstuffs, working-up proteins for foodstuffs A23J; preparations for medicinal purposes A61K; peptides containing beta-lactam rings C07D; cyclic dipeptides not having in their molecule any other peptide link than those which form their ring, e.g. piperazine-2,5-diones, C07D; ergot alkaloids of the cyclic peptide type C07D519/02; macromolecular compounds having statistically distributed amino acid units in their molecules, i.e. when the preparation does not provide for a specific; but for a random sequence of the amino acid units, homopolyamides and block copolyamides derived from amino acids C08G69/00; macromolecular products derived from proteins C08H1/00; preparation of glue or gelatine C09H; single cell proteins, enzymes C12N; genetic engineering processes for obtaining peptides C12N15/00; compositions for measuring or testing processes involving enzymes C12Q; investigation or analysis of biological material G01N33/00)
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Classificazione geografica
- Regione: Lazio
Bibliografia
1. F. Palmieri (2004) Pflugers Arch. - Eur. J. Physiol. 447, 689-7092. E. Pebay-Peyroula, C. Dahout-Gonzalez , R. Kahn, V. Trezeguet, G.J. Lauquin, G. Brandolin (2003) Nature 426, 39-44
3. Z. Xie, E. Turk and E. M. Wright (2000) J. Biol. Chem. 275, 25959-25964
4. M. Sahin-Toth, A. Karlin and H.R. Kaback (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 10729-10732
5. N. Tamura, S. Konishi, S. Iwaki, T. Kimura-Someya, S. Nada and A. Yamaguchi (2001) J. Biol. Chem. 276, 20330-20339
6. F. Palmieri, E. Quagliariello and M. Klingenberg (1972) Eur. J. Biochem. 29, 408-416.
7. R. Krämer and F. Palmieri in "Molecular Mechanisms in Bioenergetics" (L. Ernster ed.), Elsevier Science Publishers B.V., Amsterdam, (1992) 359-384
8. F. Bisaccia, C. Indiveri and F. Palmieri (1985) Biochim. Biophys. Acta 810, 362-369
9. C. Indiveri, F. Palmieri, F. Bisaccia and R. Krämer (1987) Biochim. Biophys. Acta, 890, 310-318
10. C. Indiveri, T. Dierks, R. Krämer and F. Palmieri (1991) Eur. J. Biochem. 198, 339-347
11. M.J. Runswick, J.E. Walker, F. Bisaccia, V. Iacobazzi and F. Palmieri (1990) Biochemistry 29, 11033-11040
12. V. Iacobazzi, F. Palmieri, M.J. Runswick and J.E. Walker (1992) DNA Sequence 3, 79-88
13. V. Dolce, A. Messina, A. Cambria and F. Palmieri (1994) DNA Sequence 5, 103-109
14. S. Piccininni, V. Iacobazzi, G. Lauria, M. Rocchi and F. Palmieri (1998) Cytogenet. Cell Genet. 83, 256-257
15. F. Palmieri (1994) FEBS Lett. 346, 48-54
16. F. Bisaccia, L. Capobianco, G. Brandolin and F. Palmieri (1994) Biochemistry 33, 3705-3713
17. G. Fiermonte, J.E. Walker and F. Palmieri (1993) Biochem. J. 294, 293-299
18. H. Wohlrab and C. Briggs (1994) Biochemistry 33, 9371-9375
19. R.S. Kaplan, J.A. Mayor, D.A. Gremse and D.O. Wood (1995) J. Biol. Chem. 270, 4108-4114
20. Y. Xu, J.A. Mayor, D. Gremse, D.O. Wood and R.S. Kaplan (1995) Biochem. Biophys. Res. Commun. 207, 783-789
21. G. Fiermonte, V. Dolce and F. Palmieri (1998) J. Biol. Chem. 273, 22782-22787
22. L. Palmieri, A. Vozza, G. Agrimi, V. De Marco, M.J. Runswick, F. Palmieri and J.E. Walker (1999) J. Biol. Chem. 274, 22184-22190
23. G. Fiermonte, V. Dolce, L. Palmieri, M. Ventura, M.J. Runswick, F. Palmieri and J.E. Walker (2001) J. Biol. Chem. 276, 8225-8230
24. V. Dolce, F. Fiermonte, M.J. Runswick, F. Palmieri and J.E. Walker (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 2284-2288
25. L. Palmieri, B. Pardo, F.M. Lasorsa, A. del Arco, K. Kobayashi, M. Iijima, M.J. Runswick, J.E. Walker, T. Saheki, J. Satrustegui and F. Palmieri (2001) EMBO J. 20, 5060-5069
26. L. Palmieri, G. Agrimi, M.J. Runswick, I.M. Fearnley, F. Palmieri and J.E. Walker (2001) J. Biol. Chem. 276, 1916-1922
27. G. Fiermonte, L. Palmieri, S. Todisco, G. Agrimi, F. Palmieri and J. E. Walker (2002) J. Biol. Chem. 277, 19289-19294
28. C.M.T. Marobbio, A. Vozza, M. Harding, F. Bisaccia, F. Palmieri and J.E. Walker (2002) EMBO J. 21, 5653-5661
29. C.M.T. Marobbio, G. Agrimi, F.M. Lasorsa and F. Palmieri (2003) EMBO J. 22, 5975 5982
30. A. Vozza, E. Blanco, L. Palmieri and F. Palmieri (2004) J. Biol. Chem. 279, 20850 20857
31. G. Fiermonte, F. De Leonardis, S. Todisco, L. Palmieri, F.M. Lasorsa and F. Palmieri (2004) J. Biol. Chem. 279, 30722 30730
32. C.M.T. Marobbio, M.A. Di Noia, and F. Palmieri (2006) Biochem. J. 393, 441-446
33. S. Todisco, G. Agrimi, A. Castegna and F. Palmieri (2006) J. Biol. Chem. 281, 1524-1531
34. F. Palmieri, F. Bisaccia, L. Capobianco, V. Dolce, G. Fiermonte, V. Iacobazzi, C. Indiveri and L. Palmieri (1996) Biochim. Biophys. Acta 1275, 127-132
35. V. Stipani, A.R. Cappello, L. Daddabbo, D. Natuzzi, D.V. Miniero, I. Stipani and F. Palmieri (2001) Biochemistry 40, 15805-15810
36. B. Morozzo della Rocca, G. Lauria, F. Venerini, L. Palmieri, F. Polizio, L. Capobianco, V. Stipani, J. Pedersen, A.R. Cappello, A. Desideri, F. Palmieri (2003) Biochemistry 42, 5493-5499
37. B. Morozzo della Rocca, D.V. Miniero, G. Tasco, V. Dolce, M. Falconi, A. Ludovico, A.R. Cappello, P. Sanchez, I. Stipani, R. Casadio, A. Desideri and F. Palmieri (2005) Mol. Membr. Biol. 22, 443-452
38. Falconi M., Chillemi G., Di Marino D., D’annessa I., Morozzo della Rocca B., Palmieri L., Desideri A.
Proteins: Structure Function and Genetics 2006, in press
39. A. Palmisano, V. Zara, A. Honlinger, A. Vozza, P.J. Dekker, N. Pfanner, F. Palmieri (1998) Biochem. J. 333, 151-158
40. Truscott, K.N. and Pfanner, N. (1999) Biol. Chem. 380, 1151-1156.
41. Tokatlidis, K. and Schatz, G. (1999) J. Biol. Chem. 274, 35285-35288
42. Zara, V., Ferramosca, A. and Rassow, J. (2003b) Recent Res. Devel. Mol. Cell. Biol. 4, 101-114.
43. Zara, V., Rassow, J., Wachter, E., Tropschug, M., Palmieri, F., Neupert, W. and Pfanner, N. (1991). Eur. J. Biochem. 198, 405-410.
44. Zara, V., Palmieri, F., Mahlke, K. and Pfanner, N. (1992) J. Biol. Chem. 267, 12077-12081.
45. Zara, V., Ferramosca, A., Palmisano, I., Palmieri, F. and Rassow, J. (2003c) J. Mol. Biol. 325, 399-408.
46. Zara, V., Ferramosca, A., Papatheodorou, P., Palmieri, F. and Rassow, J. (2005) J. Cell Sci. 118, 3985-3995.
Parole Chiave
TRASPORTATORI MITOCONDRIALI, MUTAGENESI SITO DIRETTA, SPETTROSCOPIA EPR, IMPORT DI PROTEINE, MODELLAZIONE MOLECOLARE, SEGNALI DI TARGETINGStruttura e biogenesi di proteine di trasporto dei mitocondri
Università degli Studi di Roma "Tor Vergata"Abstract
Il presente progetto di ricerca è inteso a studiare la struttura, le relazioni struttura-funzione e la biogenesi dei carrier mitocondriali. Mediante una stretta collaborazione di 3 unità di ricerca con specifiche competenze, questo progetto utilizzerà una combinazione di tecniche biochimiche e biofisiche mirate a definire le caratteristiche strutturali-dinamiche-funzionali, nonchè a definire i meccanismi di import nei mitocondri, dei trasportatori mitocondriali e in particolare del carrier del chetoglutarato (OGC) e del citrato ( CIC) .L’unità di Bari mutagenizzerà amminoacidi singoli di carrier mitocondriali come l’OGC allo scopo di identificare i residui che sono essenziali per l’attività di trasporto, preparerà inoltre plasmidi e mutanti (singoli-Cys, doppi-Cys, mutanti contenenti un triptofano e una cisteina) che saranno messi a disposizione delle altre unità partecipanti a questo progetto per studi spettroscopici e di biogenesi. Tutti i mutanti saranno espressi in E. coli, purificati, incorporati in liposomi ed analizzati per l’attività di trasporto. I mutanti singoli-Cys ricostituiti nei liposomi saranno saggiati per loro sensibilità a reagenti SH permeabili e impermeabili, in presenza o assenza di substrati o inibitori. Inoltre, sarà misurato il legame di [14C]N-etilmaleimide ai mutanti in presenza o assenza di altri reagenti SH, substrati o inibitori. L’unità di Roma effettuerà misure di EPR del nitrossido legato selettivamente ad una singola cisteina >>>
Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Giuseppe Rotilio Università degli Studi di ROMA "Tor Vergata"Obiettivo del Programma di Ricerca
La struttura secondaria e terziaria dei carrier mitocondriali, è solo parzialmente definita e di conseguenza, il livello di comprensione a livello molecolare del loro meccanismo di funzionamento è molto scarso, a dispetto dell’importante ruolo svolto da questa classe di proteine. Anche il processo di “import” dei carrier mitocondriali dal citoplasma ai mitocondri (biogenesi) è poco noto.L’obiettivo di questo progetto di ricerca è di acquisire informazioni strutturali sui carrier mitocondriali, in particolare sui loro domini transmembrana, studiare alcune importanti relazioni struttura-funzione e chiarire il processo di biogenesi dei carrier mitocondriali. Si perseguirà questo obiettivo tramite una stretta collaborazione tra tre unità di ricerca, dislocate in diverse università italiane, che hanno specifiche competenze ed hanno già collaborato tra loro. I risultati finora ottenuti da queste unità rappresentano il punto di partenza delle attività di ricerca del presente progetto, i cui scopi dettagliati per i prossimi 2 anni sono:
- identificazione degli amminoacidi strutturalmente e funzionalmente importanti nei trasportatori mitocondriali, in particolare nel carrier del chetoglutarato (OGC);
- localizzazione degli amminoacidi importanti dei trasportatori mitocondriali in relazione alla parte idrofobica della membrana, al percorso o via (idrofilica) di traslocazione del substrato (canale) tra i domini transmembrana, e al sito di legame di substrati o >>>
Durata
24 mesiBase di partenza scientifica nazionale o internazionale
Più di un quinto di tutte le proteine sono proteine transmembrana, che attraversano varie volte la membrana con la loro catena polipeptidica. Le proteine transmembrana sono responsabili di molte importanti funzioni, tra le quali quelle di trasportare molecole verso l'interno e l'esterno di cellule o organuli cellulari. Nonostante la loro importanza, solo in pochissimi casi è nota la loro struttura ad alta risoluzione e di conseguenza, la comprensione a livello molecolare del loro meccanismo è molto scarsa. Questa situazione dipende dal fatto che le proteine di membrana in genere, e le proteine di trasporto in particolare, sono molto difficilmente cristallizzabili e caratterizzabili strutturalmente, a causa della loro idrofobicità e in molti casi della loro natura metastabile. La completa caratterizzazione di proteine di membrana è uno dei principali obiettivi della biologia della prossima decade e richiede uno sforzo comune che unisca insieme conoscenze diverse come il clonaggio, la purificazione,la ricostituzione, l’ applicazione di tecniche spettroscopiche e la modellazione computazionale.I trasportatori o carrier mitocondriali (CM) sono una famiglia di proteine di membrana che sono localizzate, con qualche eccezione, nella membrana interna dei mitocondri (1). La loro comune funzione è quella di collegare il citoplasma e i mitocondri catalizzando il passaggio di un gran numero di soluti attraverso la membrana mitocondriale. Questo legame >>>
