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INIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE

PROGRAMMA DI RICERCA 2006

italiano - english
Programmi di ricerca simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
  • CHEMISTRY; METALLURGY
    • BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
      • MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
      • MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
Classificazione geografica
Bibliografia
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Parole Chiave
P53, P63, P73, MODIFICAZIONI POST-TRADUZIONALI, IMMUNOPRECIPITAZIONE DELLA CROMATINA CHIP, GENI BERSAGLIO IN VIVO, CHIP ON CHIP

Analisi genomica delle interazioni di membri della famiglia p53 sui promotori repressi.

Università degli Studi di Milano
Abstract
L’inizio della trascrizione è uno dei meccanismi chiave che determina l’espressione di una proteina in un preciso contesto cellulare ed in un particolare momento. Tale processo è regolato attraverso il legame di fattori di trascrizione –TFs- a brevi sequenze di DNA contenute nei promotori e negli enhancers. L’oncosoppressore p53 è un fattore trascrizionale che svolge un ruolo fondamentale nella risposta cellulare ad una serie di stimoli che possono indurre danno. Le proteine omologhe p63/p73 sono coinvolte in numerosi processi dello sviluppo, come dimostrato dai dati genetici in modelli di Zebrafish, murini e in patologie umane. Una complessa interazione tra i membri della famiglia avviene in condizioni normali, ed in seguito a stimoli che danneggiano il DNA. La chiave per la comprensione della strategia trascrizionale di questa famiglia di proteine consiste (i) nel determinare i numerosi loci genomici legati in vivo ed i relativi geni regolati, sia positivamente che negativamente; (ii) nello studio degli effetti delle modificazioni post-traduzionali e delle interazioni proteina-proteina selettive per i diversi target. Lo scopo del Progetto è quello di far luce su questi aspetti della biologia di p53/p63/p73. Abbiamo messo a punto le tecniche di analisi dei profili di espressione e di ChIP on chip per lo studio in vivo del legame al DNA, e della funzione, su scala genomica. Il Progetto è suddiviso nei seguenti obiettivi. (1) Sviluppo e validazione del MARM-2. Un array di >>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Roberto Mantovani Università degli Studi di MILANO
Obiettivo del Programma di Ricerca
L’obiettivo generale del Progetto consiste nell’approfondire i meccanismi molecolari alla base dell’attività della famiglia dei fattori trascrizionali p53/p63/p73, attraverso l’analisi dei loro target genomici, delle modificazioni post-traduzionali e delle interazioni proteina-proteina in vivo. La strategia del nostro approccio consiste nella possibilità di monitorare in vivo il legame dei fattori di trascrizione ai loro target in maniera rapida, efficiente e ad un costo contenuto, in modo da rendere possible la successive analisi in diverse condizioni e trattamenti cellulari.

Il Progetto è suddiviso in due parti comuni e in parti specifiche per ogni Unità. L‘obiettivo comune consiste negli esperimenti di ChIP on chip che verranno condotti prevalentemente dalla RU-Mantovani, al fine di mettere a punto le condizioni per ottimizzare il sistema degli array pathway-specifici MARM-2 da noi sviluppati e per validare il nuovo reagente 12K FL-Array. Il MARM-2 verrà sviluppato insieme alla RU-Levrero, che ha la possibilità di spottare gli oligonucleotidi sui chip; l’array FL è stato sviluppato e validato per il profilo degli mRNA dalla RU-Schneider. Per questo obiettivo utilizzeremo basi cellulari comuni e ristrette (HCT116 per p53, p73 e alcuni esperimenti per p63; PMSC per p53/p73; cheratinociti umani primary per p63).

Gli obiettivi specifici verranno invece sviluppati da ogni RU individuale, che metterà a fuoco aspetti specifici della biologia di >>>

Durata
24 mesi
Base di partenza scientifica nazionale o internazionale
L’inizio della trascrizione è uno dei meccanismi chiave che determina l’espressione di una proteina in un preciso contesto cellulare ed in un particolare momento. L’analisi dettagliata delle basi molecolari di questa regolazione è di fondamentale importanza al fine di comprendere alcuni complessi processi biologici come il differenziamento e lo sviluppo.
La trasformazione tumorale risulta dall’accumulo progressivo di mutazioni dei geni che controllano la proliferazione e la morte cellulare. Oltre a tali alterazioni genetiche che interessano i proto-oncogeni cellulari ed i geni soppressori tumorali, fattori esterni ed alterazioni epigenetiche del DNA modificano i profili di espressione di geni che hanno un ruolo importante nella patogenesi dei tumori umani.

Negli organismi eucarioti più evoluti, l’oncosoppresssore p53 svolge un ruolo fondamentale nella risposta cellulare ad una serie di stimoli extra-cellulari che inducono danno al DNA.
La pathway di p53 costituisce una via segnaletica nodale che integra informazioni ricevute da molte altre pathways responsabili della definizione del contesto e del destino cellulare, quali l’apoptosi, l’arresto della proliferazione, il differenziamento e la senescenza (1). Il trattamento con agenti che danneggiano il DNA induce una serie di modificazioni post-traduzionali dell’oncosoppressore, quali fosforilazione, acetilazione e sumolazione, che attivano trascrizionalmente p53, regolando il suo legame al DNA, la >>>