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INIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE

PROGRAMMA DI RICERCA 2006

italiano - english
Unità di Ricerca
Programmi di ricerca simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
  • CHEMISTRY; METALLURGY
    • BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
      • MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
      • MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
Classificazione geografica
Bibliografia
Abascal FR Zardoya and D Posada 2005 Bioinformatics 12:12
Arizza V Cammarata M Tomasino C and Parrinello N 1995 Phenoloxidase J Inv Pathol 66:297-302
Azumi K Ishimoto R Fujita T Nonaka M Yokosawa H 2000 Zool Sci 17:625-32
Azumi K De Santis R De Tomaso A Rigoutsos I Yoshizaki F Pinto MR Marino R. Shida K. Ikeda M Ikeda M Arai M Inoue Y Shimizu T Satoh N Rokhsar DS Du Pasquier L Kasahara M Satake M Nonaka M 2003 Immunogenetics 55:570-81
Ballarin L Cima F Sabbadin A 1995 ZOOL SCI 12:757-64
Ballarin L Cima F Sabbadin A 1998 Dev Comp Immunol 22:479-92.
Ballarin L Franchini A Ottaviani E Sabbadin A 2001 Biol Bull 201:59-64
Ballarin L., Tonello C, Sabbadin A 2000 Marine Biology. 136:823-827
Ballarin L Menin A Franchi N Bertoloni G Cima F 2005 Invertebr Survival J 2:1-5
Ballarin L Cima F Sabbadin A 1994 Dev Comp Immunol 18:467-81.
Beck G O’Brien RF Habicht GS Stillman DL Cooper EL Raftos DA 1993 Cell Immunol 146:284-99
Beck G Habicht GS Mol Immunol 1991 28:577-84
Bonizzoni PR Rizzi and G Pesole 2005 BMC Bioinformatics 6:244
Cameron CB Garey JR Swalla BJ 2000 Proc Natl Acad Sci 97:4469-74
Cammarata M Arizza V Vazzana M Parrinello N 1996 It J Zool 63:345-51
Cima F Sabbadin A Ballarin L 2004 Dev Comp Immunol 28:881-89.
Coombe DR Ey PL Jenkin CR 1984 J Comp Physiol Bull 154: 509-21
De Tomaso AW Nyholm SV Palmeri KJ Ishizuka KJ Ludington WB Mitchel K Weissman IL 2005 Nature 438:454-59
Dehal PY Satou RK Campbell J Chapman B Degnan A De Tomaso B Davidson A Di Gregorio M Gelpke DM Goodstein N Harafuji KE Hastings I Ho K Hotta W Huang T Kawashima P Lemaire D Martinez IA Meinertzhagen S Necula M Nonaka N Putnam S Rash H Saiga M Satake A Terry L Yamada HG Wang S Awazu K Azumi J Boore M Branno S Chin-Bow R DeSantis S Doyle P Francino DN Keys S Haga Hayashi K Hino KS Imai K Inaba S Kano K Kobayashi M Kobayashi BI Lee KW Makabe C Manohar G Matassi M Medina Y Mochizuki S Mount T Morishita S Miura A Nakayama S Nishizaka H Nomoto F Ohta K Oishi I Rigoutsos M Sano A Sasaki Y Sasakura E Shoguchi T Shin-i A Spagnuolo D Stainier MM Suzuki O Tassy N Takatori M Tokuoka K Yagi F Yoshizaki S Wada C Zhang PD Hyatt F Larimer C Detter N Doggett T Glavina T Hawkins P Richardson S Lucas Y Kohara M Levine N Satoh and DS Rokhsar 2002 Science 298:2157-67
Dobzhansky 1973 Zygon. 8:261-81
Dodd RB and K. Drickamer 2001 Glycobiology 11:71-79
Drickamer K 1988. J Biol Chem 263:9557-60
Green PL Nair SV Raftos DA 2003. Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 125:279-89
Hirabayashi J Kasai K 1993 . Glycobiology 3:297-304
Kelly KL Cooper EL Raftos DA 1992. Comp Biochem Physiol 103B:749-53
Lee CL Atanelov B Modrek and Y Xing 2003. Nucleic Acids Res 31:101-5
Menin A Ballarin L 2006. INVERT SURV J 3:18-24
Menin A Del Favero M Cima F Ballarin L 2005 . Mar Biol 148:225-30.
Nair SV Pearce S Green PL Mahajan D Newton RA Raftos DA 2000.Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol 125:279-89
Nonaka M Azumi K 1999. Dev Comp Immunol 23:421-27
Nonaka M Azumi K Ji X Namikawa-Yamada C Sasaki M Saiga H Dodds AW Sekine H Homma MK Matsushita M Endo Y Fujita T 1999 J Immunol 162:387-91
Parrinello N 1996 In: Invertebrate Immunology (Rinkevich B, Muller WEG) Springer-Verlag, Berlin 190-216
Parrinello N and Rindone D 1981 Dev Comp Immunology 5:33-42
Parrinello N Arizza V 1992 Boll Zool 59:183-89.
Parrinello N Arizza V Cammarata M Parrinello DM 1993 Dev Comp Immunology 17:19-27
Parrinello N Cooper EL 1994 Exp Zool 267:616-23
Parrinello N De Leo G Di Bella MA 1990 J Invert Pathology 56:181-89
Parrinello N Patricolo E and Canicattì C 1984 Biol Bull 167:229-37
Parrinello N Patricolo E and Canicattì C 1984 Biol Bull 167:238-50
Patthy L 1999 Gene 238:103-14
Pinto MR Chinnici CM Kimura Y Melillo D Marino R Spruce LA De Santis R Parrinello N Lambris JD 2003 J Immunol 171:5521-8
Posada D and KA Crandall 1998 Bioinformatics 14:817-18
Quesenberry MS Ahmed H Elola MT O’leary N And Vasta GR 2003 Integr Comp Biol 43:323–30
Raftos DA 1996 Immunol Cell Biol 74:26-31
Raftos DA Cooper EL Stillman DL Habicht GS Beck G 1992 Lymphokine Cytokine Res 11:235-40
Raftos DA Nair S Robbins J Newton R Peters R 2002 Dev Comp Immunol 26:307-12
Raftos DA Robbins J Newton R Nair S 2003 Comp Biochem Physiol 134A: 377-86
Raftos DA Stillman DL Cooper EL 1998 J Invertebr Pathol 72:44-9
Raftos DA Cooper EL 1991 J Exp Zool 260:391-400
Ronquist F and JP Huelsenbeck 2003 Bioinformatics 19:1572-74
Sabbadin A 1982 Amer Zool 22:765-73
Satou Y Satoh N Satake M Kawazoe Y Kasuya A 2003 Biochem Biophys Res Commun 302:207-18
Sekine H Kenjo A Azumi K Ohi G Takahashi M Kasukawa R Ichikawa N Nakata M Mizuochi T Matsushita M Endo Y Fujita T 2001 J Immunol 167:4504-10
Seo CC Kube M Edvardsen RB Jensen MF Beck A Spriet E Gorsky G Thompson EM Lehrach Reinhardt R and Chourrout D 2001 Science 294:2506
Sharon N.& H. Lis 2003 Lectins, Second Edition Kluwer Academic Publishers London pp.1-454
Sharon N, Lis H 2004 Glycobiology. 14:53-62
Smith VJ, Peddie CM 1992 Biol Bull 183:211-19
Swalla BJ 2001 In: “The biology of ascidians”, H Sawada H Yokosawa & CC Lambert Eds. Springer Tokyo, pp. 219-24
Thanaraj TA S Stamm F Clark JJ Riethoven V Le Texier and J Muilu 2004. ASD: the Alternative Splicing Database. Nucleic Acids Res 32:64-9.
Vasta GR JJ Marchalonis and J Decker 1986. J Immunol 137:3216–23
Parole Chiave
FILOGENESI MOLECOLARE, INFIAMMAZIONE, GALECTINE, CITOCHINE, ASCIDIE, EVOLUZIONE, IMMUNITÀ INNATA, EMOCITA, ESPRESSIONE

Il repertorio delle lectine nei protocordati. Evoluzione dei meccanismi di riconoscimento e dell'immunità innata.

Università degli Studi di Palermo
Abstract
Il sistema di difesa innato si interseca con l’origine della biodiversità genetica, le interazioni cellula-cellula,cellula-lectine,cellula-matrice, ed appare come prodotto di cellule e marcatori molecolari per il self-riconoscimento che evolve con molecole e meccanismi per identificare e distruggere il non-self.
Il programma riguarda l’immunoreattività di urocordati(ascidie) gruppo chiave nella filogenesi essendo alla base della linea dei cordati ed include specie solitarie e coloniali provvisti di corda e tubo neurale in fase larvale.La filogenesi molecolare indica che essi sono ramo monofiletico della linea evolutiva dei deuterostomi prossima ai vertebrati con cui condividono geni e molecole dell’immunità innata. La posizione filogenetica giustifica il crescente interesse per l’immunobiologia delle ascidie ed offre il vantaggio della conoscenza del loro genoma e delle strategie di sviluppo così da poter coniugare studi di espressione di proteine e regolazione genica. Poiché le risposte infiammatorie sono considerate ancestrali dell’immunità siamo interessati a comparare la dinamica del loro complesso sistema genico analizzando geni ed eventi molecolari e cellulari. Due diverse specie di ascidie, appartenenti a cladi distinti, diverse per ciclo vitale emergono come organismi modello per studi di immunobiologia. Ciona intestinalis(Phlebobranchia)nota per la sequenza del genoma e numerosi EST emocitari, di cui è stata studiata la risposta infiammatoria. L’ascidia >>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Nicolo' Parrinello Università degli Studi di PALERMO
Obiettivo del Programma di Ricerca
“Nothing in biology makes sense except in the light of evolution” (Dobzhansky 1973). Oggi questa frase è supportata dalle conoscenze sulla stabilità del genoma e sua “evolutività” che ne amplificano il senso, e spinge allo studio di famiglie geniche, funzione delle proteine, espressione genica e struttura di proteine multifunzione. Sequenze geniche e pattern di espressione devono essere analizzati dal punto di vista funzionale e comparato. Questo approccio applicato a modelli animali, potrebbe contribuire allo studio di aspetti salienti della filogenesi molecolare relativi a molecole e meccanismi conservati o innovativi. Negli invertebrati il sistema immunitario innato è coinvolto nell’origine, il successo ed il mantenimento della biodiversità genetica. Origine ed evoluzione dell’immunità innata che include interazioni cellula-cellula, cellula-citochine, cellule-lectine, cellula-matrice, sembrano il prodotto di markers cellulari e genetici per il riconoscimento del self che si sviluppa con molecole e meccanismi per identificare e distruggere il non-self. Da ciò l’importanza di studiare un gruppo chiave per la filogenesi. Noi studiamo gli Urocordati(Tunicati), animali filtratori appartenenti alla linea dei Cordati che includono animali sessili o planctonici, solitari o coloniali, con riproduzione sessuale e asessuale,che hanno notocorda e tubo neurale solo durante lo stadio larvale. Recenti studi di filogenesi molecolare(rRNA, geni dell’actina muscolare) supportano l’ipotesi >>>

Durata
24 mesi
Base di partenza scientifica nazionale o internazionale
Gli Ascidiacei (Tunicata), sono stati usati per studi di embriologia e biologia dello sviluppo, infatti il loro piano morfogenetico precoce è sovrapponibile a quello dei vertebrati. In tempi recenti, l’interesse è sensibilmente aumentato, spostandosi alla genomica. Disponiamo di dati sul genoma di Ciona intestinalis che rivelano un’alta densità genica e un basso numero di geni (Seo et al. 2001) in accordo con le piccole famiglie geniche e la bassa ridondanza prevista dall’ipotesi di un primitivo genoma non duplicato dei cordati.
I Tunicati, come gli altri invertebrati, sono provvisti di immunità cellulo-mediata e umorale (cfr. Parrinello 1995; Raftos 1996;Parrinello & Cooper 1994; Ballarin et al. 2000). L’immunità cellulo-mediata è stata rivelata da reazioni di istocompatibilità come quelle dei vertebrati, così l’alloriconoscimento di Styela plicata ha proprietà di specificità e memoria immunologica, e recettori specifici possono essere diretti agli antigeni di istocompatibilità codificati da un singolo locus con sei alleli. La risposta allogenica prodotta comprende la partecipazione di numerose cellule effettrici infiammatorie, probabilmente originate dalle cellule staminali nei noduli emopoietici, responsabili dell’istocompatibilità (cfr. Parrinello 1996).La risposta infiammatoria è stata studiata in C. intestinalis dopo stimolazione sottocuticolare con diversi agenti estranei (Parrinello et al.1984;1990;Parrinello 1981; De Leo et al. ), ed essa >>>