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PROGRAMMA DI RICERCA 2006

italiano - english
Programmi di ricerca simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
  • CHEMISTRY; METALLURGY
    • BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
      • MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
      • MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
Bibliografia
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Parole Chiave
ERITROPOIESI, ANEMIA DI DIAMOND-BLACKFAN, PROTEOMICA, MICROARRAYS A CDNA, GENI SOX

Eritropoiesi normale e patologica: caratterizzazione molecolare mediante tecnologie avanzate a resa elevata.

Abstract
L’avvento di tecnologie avanzate ad alta resa ha permesso di definire i processi cellulari e molecolari utilizzando un approccio omnicomprensivo e sistematico. La ricerca si propone di utilizzare strategie di questo tipo per rivelare nuovi aspetti dell’eritropoiesi normale e patologica. Il gruppo si è formato fondendo le specifiche competenze di ogni unità. L’unità di Milano si propone di studiare, attraverso un approccio di genomica funzionale, l’espressione genica nel sistema eritroide nel corso dello sviluppo embrionale e durante la maturazione cellulare nel topo. L’identificazione dei geni differenzialmente espressi può essere utile per sviluppare nuovi approcci terapeutici per varie malattie ereditarie dell’eritropoiesi, fra cui le talassemie e la Anemia di Diamond-Blackfan (DBA). L’analisi di DNA microarray è già stata condotta su popolazioni cellulari purificate da fegato fetale durante la transizione da ematopoiesi embrionale ad adulta. I geni considerati promettenti (tra cui sono già stati individuati i fattori trascrizionali Sox6 e Sox4) verranno studiati funzionalmente attraverso overespressione o silenziamento. In collaborazione con l’unità di Napoli, si cercherà di identificare, attraverso un approccio di proteomica differenziale, proteine la cui espressione è regolata da Sox4 e Sox6. L’approccio genomico potrà contribuire ad individuare geni importanti per il differenziamento dell’eritroblasto, potenzialmente coinvolti nella patogenesi della DBA. La banca dati >>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Irma Dianzani Università degli Studi del PIEMONTE ORIENTALE "Amedeo Avogadro"-Vercelli
Obiettivo del Programma di Ricerca
L’avvento di tecnologie avanzate ad alta resa ha permesso di definire i processi cellulari e molecolari utilizzando un approccio sistematico. La presente ricerca si propone di utilizzare strategie di questo tipo per rivelare nuovi aspetti dell’eritropoiesi normale e patologica. Il gruppo si è formato fondendo le specifiche competenze di ogni unità in campo di eritropoiesi e di tecnologie avanzate. I progetti delle quattro unità sono tra loro integrati e complementari al raggiungimento degli obiettivi previsti.
L’unità di Milano è nata da uno dei maggiori gruppi italiani esperti in campo di ematologia molecolare di base, le cui competenze sono focalizzate sui meccanismi di controllo trascrizionale dell’eritropoiesi, anche utilizzando microarray di espressione. L’unità fornisce le sue conoscenze sulla fisiologia dell’eritropoiesi e la propria esperienza sull’analisi di espressione tramite microarray.
L’unità di Novara da molti anni si occupa di studiare le basi molecolari dell’Anemia di Diamond-Blackfan (DBA), una malattia ereditaria dovuta a difetto del progenitore eritroide. Ha partecipato al lavoro che ha condotto all’identificazione di mutazioni nel gene che codifica RPS19, una proteina ribosomale strutturale, ed ha suggerito un ruolo per la proteina nel controllo traduzionale dell’eritropoiesi.
All’unità di Torino fa capo il centro clinico che coordina il Registro Italiano dell’Anemia di Diamond-Blackfan: oltre a fornire le competenze cliniche sulla >>>

Durata
24 mesi
Base di partenza scientifica nazionale o internazionale
E’ noto che le migliaia di geni che compongono il genoma di una cellula svolgono le loro funzioni in maniera complessa e finemente orchestrata. La ricerca tradizionale in campo di biologia molecolare, tuttavia, si svolge andando a determinare la funzione di un gene per esperimento. Negli ultimi anni sono stati implementati metodi che si basano su tecnologie avanzate ad alta resa che permettono di definire i processi cellulari e molecolari utilizzando un approccio sistematico. Tali metodi richiedono un approccio di tipo multidisciplinare, incluse le competenze bioinformatiche.
Le tecniche basate sui microarray si propongono di monitorare l’intero pattern di espressione dei geni di un tessuto in una singola analisi, andando quindi a valutare migliaia di trascritti simultaneamente (Ekins et al.1999). Il microarray include sonde ordinatamente allineate in grado di riconoscere migliaia di trascritti e richiede specifiche apparecchiature robotizzate e di imaging per l’analisi dei risultati. Sono prodotti generalmente utilizzando supporti di vetro su cui sono legate sonde di identità nota. L’analisi avviene per ibridazione con l’RNA estratto da un tessuto determinato, previa conversione in cDNA. Per l’interpretazione dei risultati sono necessarie metodologie bioinformatiche che prevedono anche il confronto con database pubblici.
Gli attuali studi di proteomica sono focalizzati su due aree principali: la proteomica di espressione e la proteomica funzionale (Neubauer et >>>