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PROGRAMMA DI RICERCA 2006
italiano - english
Unità di Ricerca
Programmi di ricerca simili:
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- 10 - Genomica e proteomica dei gliomi cerebrali: un approccio bioinformatico
Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze agrarie e veterinarie
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- PHYSICS
- MEASURING (counting G06M); TESTING
- MEASURING LINEAR OR ANGULAR SPEED, ACCELERATION, DECELERATION, OR SHOCK; INDICATING PRESENCE, ABSENCE, OR DIRECTION, OF MOVEMENT (measuring or rec ording blood flow A61B5/02, A61B8/06; monitoring speed or deceleration of electrically-propelled vehicles B60L3/00; vehicle lighting systems adapted to indicate speed B60Q1/54; determining position or course in navigation, measuring ground distance in geodesy or surveying G01C; combined measuring devices for measuring two or more variables of movement G01C23/00; measuring velocity of sound G01H; measuring velocity of light G01J7/00; measuring direction or velocity of solid objects by reception or emission of radiowaves or other waves and based on propagation effects, e.g. Doppler effect, propagation time, direction of propagation, G01S; measuring speed of nuclear radiation G01T; measuring acceleration of gravity G01V; [N: measuring, recording the speed of trains B61L23/00; speed indicators incorporated in motor vehicles B60K35/00; measuring frequency or phase G01R; traffic control G08G])
- MEASURING (counting G06M); TESTING
Classificazione geografica
- Regione: Lombardia
Bibliografia
Agrawal GK, Thelen JJ. (2005) Development of a simplified, economical polyacrylamide gel staining protocol for phosphoproteins. Proteomics. 5: 4684-8.Alkharouf NW et al. Online analytical processing (OLAP): a fast and effective data mining tool for gene expression databases. J Biomed Biotechnol. 2005;181-8.
Bini L., Roncada P. (1999) Il progetto proteoma. Strumenti innovativi per le Ricerca Avanzata nelle produzioni Animali, Milano, CNR.
Bruckmaier RM. Gene expression of factors related to the immune reaction in response to intramammary Escherichia coli lipopolysaccharide challenge. J Dairy Res 2005;72:120-4.
Calamari L., Arrigoni N., Maianti M.G., Bertoni G. (1992) - Confronto fra metodi indiretti per la valutazione del danno all'epitelio ghiandolare mammario. Atti Soc. Italiana di Buiatria, 24, 129-140.
Castillo C et al., Plasma malonaldehyde (MDA) and total antioxidant status (TAS) during lactation in dairy cows. Res Vet Sci 80: 133-139, 2006
Ceciliani et al, Identification of the bovine alpha1-acid glycoprotein in colostrum and milk, Vet Res, 36: 735-746, 2005
Chiusano ML, Frusciante L, Toraldo G,“Inferring on the origin of the genetic code by integrated data mining” chapter of the refereed volume "Data Mining in Biomedicine" 2005.
D’Agostino,N. et al. ParPEST: a pipeline for EST data analysis based on parallel computing. BMC Bioinformatics 2005.
Dalle-Donne I, Rossi R, Giustarini D, Milzani A, Colombo R. (2003) Protein carbonyl groups as biomarkers of oxidative stress. Clin Chim Acta. 329: 23-38.
Dalle-Donne I, Scaloni A (2005) Redox proteomics: from protein modifications to cellular dysfunctions and diseases, (eds)John Wiley and Sons inc. pp 487-525,
Dalle-Donne I, Scaloni A, Giustarini D, Cavarra E, Tell G, Lungarella G, Colombo R, Rossi R, Milzani A. (2005) Proteins as biomarkers of oxidative/nitrosative stress in diseases: the contribution of redox proteomics. Mass Spectrom Rev. 24:55-99.
D'Auria E, Agostoni C, Giovannini M, Riva E, Zetterstrom R, Fortin R, Greppi GF, Bonizzi L, Roncada P. (2005) Proteomic evaluation of milk from different mammalian species as a substitute for breast milk. Acta Paediatr. 94: 1708-13.
Eckersall PD et al. Acute phase proteins in bovine milk in an experimental model of Staphylococcus aureus subclinical mastitis. J Dairy Sci. 2006;89(5):1488-501.
Fruganti G., Ranucci S., Valente C., Mangili V., Tesei B., Avellini G., Morettini B. (1984) - Determinazione di alcune attività enzimatiche nel secreto mammario di bovine. Riv. Zoot. Vet., 12, 369-375.
Gabai G et al., (2004) Oxidative stress in primiparous cows in relation to dietary starch and the progress of lactation. Anim Sci 79: 99-108, 2004
Ge Y, Rajkumar L, Guzman RC, Nandi S, Patton WF, Agnew BJ. (2004) Multiplexed fluorescence detection of phosphorylation, glycosylation, and total protein in the proteomic analysis of breast cancer refractoriness. Proteomics. 4: 3464-7.
Ghezzi P, Bonetto V. (2003). Redox proteomics: identification of oxidatively modified proteins. Proteomics 3:1145–1153.
Gronlund U et al. Changes in blood and milk lymphocyte sub-populations during acute and chronic phases of Staphylococcus aureus induced bovine mastitis. Res Vet Sci. 2006;80(2):147-54.
Grune T, Merker K, Sandig G, Davies KJ. (2003). Selective degradation of oxidatively modified protein substrates by the proteasome. Biochem Biophys Res Commun 305:709– 718.
Hart C. et al Selective proteome-wide detection of hydrophobic integral membrane proteins using a novel fluorescence-based staining technology. Electrophoresis 2004, 25, 2486-2493
Holland JW, Deeth HC, Alewood PF. (2004) Proteomic analysis of kappa-casein micro-heterogeneity. Proteomics. 2004 Mar;4(3):743-52
Holland JW, Deeth HC, Alewood PF. (2005) Analysis of O-glycosylation site occupancy in bovine kappa-casein glycoforms separated by two-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 5: 990-1002.
Holland JW, Deeth HC, Alewood PF. (2006) Resolution and characterisation of multiple isoforms of bovine kappa-casein by 2-DE following a reversible cysteine-tagging enrichment strategy Proteomics. 2006 Apr 18;
Kaartinen L., Ali-Vehmas T., Sandholm M. (1990) - Effect of frequent milkings on milk NAGase, plasmin, trypsin inhibitory capacity and the quality of whey as the growth medium for the mastitis pathogens. J. Vet. Med., 37, 337-344.
Lohrke B et al., (2005) Relationship between oxidant stress and milk productivity in dairy cows. Berliner Munchener Tierarztliche Wochenschrift 118 (7/8) : 265-269, 2005
Lohrke B et al., High milk yield in dairy cows associated with oxidant stress. Online J Vet Res 8 : 70-78, 2004
Lottspeich, F. (1999). Proteome analysis: A pathway to the functional analysis of proteins. Angew Chem. Int. Ed. Engl. 38:2476–2492.
McCormick DJ, Holmes MW, Muddiman DC, Madden BJ. (2005) Mapping sites of protein phosphorylation by mass spectrometry utilizing a chemical-enzymatic approach: characterization of products from alpha-S1 casein phosphopeptides. J Proteome Res. 4: 424-34.
McDonald TL et al., Elevated extrahepatic expression and secretion of mammary-associated serum amyloid A3 (M-SAA3) into colostrum, Vet Immunol. Immunopat, 83, 203-211, 2001.
Mork T et al. Comparison of Staphylococcus aureus genotypes recovered from cases of bovine, ovine, and caprine mastitis. J Clin Microbiol. 2005;43(8):3979-84.
Murata H et al., Current research on acute phase proteins in veterinary diagnosis: an overview. Vet J.168(1):28-40, 2004.
Nielsen BH et al., Acute phase protein concentrations in serum and milk from healthy cows, cows with clinical mastitis and cows with extramammary inflammatory conditions, Vet Rec, 361-365, 2004.
Palmer DJ, Kelly VC, Smit AM, Kuy S, Knight CG, Cooper GJ. (2006) Human colostrum: Identification of minor proteins in the aqueous phase by proteomics Proteomics, 6: 2208-16.
Peli A., Di Palma B., Motti C., Talone T., Famigli-Bergamini P. (2001) - Rapporto fra l’enzima gamma-glutamil-transferasi e le cellule somatiche nel latte bovino. Atti Soc. Ital. Buiatria, 23: 241-251.
Petersen HH et al., Application of acute phase measurements in veterinary clinical chemistry,Vet Res 35, 163-187, 2004.
Schmitz S et al. Short-term changes of mRNA expression of various inflammatory factors and milk proteins in mammary tissue during LPS-induced mastitis, Domest Anim Endocrinol. 2004;26(2):111-26.
Schulenberg B, Patton WF. (2004) Combining microscale solution-phase isoelectric focusing with Multiplexed Proteomics dye staining to analyze protein post-translational modifications. Electrophoresis. 25: 2539-44.
Seegers H, et al, Production effects related to mastitis and mastitis economics in dairy cattle herds, Vet Res, 34, 475-491 2003.
Shoji H et al. Effects of human milk and spermine on hydrogen peroxide-induced oxidative damage in IEC-6 cells. J Pediatric Gastroenterol Nutr 41: 460-465, 2005
Smejkal GB, Robinson MH, Lazarev A. (2004) Comparison of fluorescent stains: relative photostability and differential staining of proteins in two-dimensional gels. Electrophoresis. 25: 2511-9.
Wu J. et al., Functional characterization of two-dimensional gel-separated proteins using sequential staining. Electrophoresis 2005, 26, 225-237:
Yamada M, Murakami K, Wallingford JC, Yuki Y. (2002) Identification of low-abundance proteins of bovine colostral and mature milk using two-dimensional electrophoresis followed by microsequencing and mass spectrometry. Electrophoresis. 23: 1153-60.
Yi M et al. WholePathwayScope: a comprehensive pathway-based analysis tool for high-throughput data. BMC Bioinformatics. 2006;7:30.
Parole Chiave
STRESS OSSIDATIVO, ENZIMI DEL LATTE, PROTEINE DI FASE ACUTA, MODIFICAZIONI POST-TRADUZIONALI, MARKERS, PROTEOMICA, ANALISI DEL TRASCRITTOMA, BIOINFORMATICA APPLICATA, DATA MININGBIOMARKER delle modificazioni post traduzionali delle proteine del latte in relazione allo stato di salute della bovina.
Università degli Studi di MilanoAbstract
L’aumento dello stress ossidativo descrive una condizione nella quale le difese sono inadeguate e i ROS (Reactive Oxygen Species) e RNS (Reactive Nitrogen Species) generati, in associazione alla caduta delle difese immunitarie contribuiscono alla patogenesi e alla progressione della malattia. Nella bovina da latte l’adeguamento del metabolismo alle richieste imposte dalla lattazione comporta uno stress ossidativo, tanto più elevato quanto maggiore è la produzione. Oltre che dal tipo di dieta e dalla produzione latte, lo stress ossidativo può essere incrementato anche a seguito dell’insorgere di processi infiammatori, in particolare di origine infettiva La mastite rappresenta probabilmente la più costosa patologia che affligge l'allevamento di bovine da latte. Le conseguenze economiche per gli allevatori, dovute a ridotta produzione, aumento della quota di rimonta e multe per elevato contenuto di cellule somatiche (alta SCC), sono enormi. In particolare le mastiti sub-cliniche e croniche si presentano in modo insidioso e l'unico sintomo è rappresentato da un aumento della conta delle cellule somatiche (SCC) nel quarto mammario interessato. La diagnosi si presenta quindi spesso difficile. L'individuazione precoce dei casi di mastite sub-clinica in una stalla rappresenta quindi un traguardo importante.Il progetto si pone come obiettivo principale quello di evidenziare, nel latte di bovine ad alta produzione colpita da mastiti subcliniche e croniche >>>
Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Gianfranco Greppi Università degli Studi di MILANOObiettivo del Programma di Ricerca
Il gruppo di lavoro costituito per il raggiungimento degli obiettivi di progetto rappresentano nel settore di riferimento, centri di elevata competenza scientifica in grado di apportare le competenze necessarie per indagare i fenomeni biologici, chimici, analitici, fisici correlati con il progetto. L’obiettivo strategico per la massimizzazione dei risultati progettuali consiste nello sviluppo di relazioni fattive e costanti tra i diversi centri, attraverso una forte leadership scientifica creando una rete virtuale di scambio di informazioni scientifiche tra tutti i partner di ricerca in grado di favorire l’accrescimento conoscitivo dell’intero gruppo, di valore maggiore rispetto al contributo delle singole unità.Il gruppo di lavoro creato appositamente per la realizzazione del presente progetto di ricerca fonde al suo interno conoscenze che abbracciano diverse discipline scientifiche lungo la filiera zootecnica. Competenze di genetica per lo studio dei meccanismi molecolari coinvolti nell’espressione del genoma a livello fenotipico collaboreranno con competenze di carattere microbiologico ed analitico rivolte alla definizione dei meccanismi di contorno, ma non meno importanti, responsabili dei processi di filiera responsabili della qualità del latte, al fine di sviluppare una indagine completa delle variabili coinvolte nel sistema. Verranno coinvolte competenze relative alla definizione di metodiche analitiche estremamente innovative che dovranno trarre spunto dalle >>>
Durata
24 mesiBase di partenza scientifica nazionale o internazionale
La caratterizzazione di struttura e funzione di molecole biologiche è supportata oramai dalla imponente produzione di dati sperimentali. La disponibilità di metodologie analitiche abbinata alle recenti tecniche bioinformatiche consente di estrarre in modo efficiente informazione da grosse quantità di dati e di investigare dati biochimici e molecolari per la caratterizzazione della funzionalità di un organismo (Chiusano, 2005; D'Agostino, 2005;) costituisce un supporto di fondamentale importanza per l’analisi di marcatori biologici o biomarkers.In particolare, la possibilità di gestire i dati organizzandoli secondo specifici criteri, quali organismo, tessuto, stadio di sviluppo e/o condizioni fisiologiche, ha enormi potenzialità in termini di identificazione di markers per l’analisi di qualità o la diagnostica. Le risposte di un organismo, popolazione o comunità naturale a situazioni di stress o malattia possono costituire un segnale integrato del disturbo, e sono quindi anche indicatrici del livello di esposizione e sono definiti come perturbazione metaboliche. In generale, una caratteristica obiettivamente misurabile e valutabile indicatrice di processi biologici fisiologici o patologici è considerata un biomarker. Biomarker possono essere usati per diagnosi/prognosi di malattie, monitoraggio di tossicità e/o efficacia terapeutica o anche indice di qualità, per la tracciabilità ma anche per definire l’origine del prodotto (fingerprint). E’ possibile considerare >>>



