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PROGRAMMA DI RICERCA 2006

italiano - english
Unità di Ricerca
Programmi di ricerca simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
Classificazione geografica
Bibliografia
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Parole Chiave
DIAGNOSI MOLECOLARE, PHYTOPHTHORA SPP., REAL TIME - PCR, NESTED - PCR, RT - PCR, REGIONI ITS DEL RDNA, ECOLOGIA, ECOSISTEMI NATURALI, COLTURE FUORI SUOLO

Nuovi metodi molecolari di diagnosi per lo studio dell'ecologia e dell'epidemiologia di specie terricole di Phytophthora potenzialmente pericolose per gli ecosistemi seminaturali, forestali e agrari

Università degli Studi "Mediterranea" di Reggio Calabria
Abstract
Questo programma di ricerca ha come obiettivi lo sviluppo e la validazione di metodi di diagnosi molecolare per lo studio dell'ecologia e dell'epidemiologia di specie invasive di Phytophthora in ambienti naturali e seminaturali ed in ecosistemi forestali e agrari. Al progetto partecipano quattro Unità Operative (UO), tra loro complementari. Due UO, in stretta collaborazione tra di loro e con ricercatori dell'Università di Berkeley (California, USA), metteranno a punto un metodo di diagnosi basato sul principio della RT-RealTime-PCR per lo studio dell'ecologia di Phytophthora spp. in ecosistemi forestali e di rilevante interesse naturalistico. Si tratta di un metodo innovativo che, oltre alla sensibilità propria della Real Time-PCR, sembrerebbe garantire una maggiore affidabilità, grazie all'impiego dell'mRNA come marcatore molecolare. Il metodo prevede la determinazione quantitativa dei trascritti dei geni codificanti per la citocromo ossidasi (geni COX). La regione scelta per disegnare i primer si trova all'interno dei geni COX I e COX II. Poichè la citocromo ossidasi è un enzima della fase finale della catena respiratoria nei mitocondri, i geni COX sono espressi esclusivamente nelle cellule vive. Questo metodo di diagnosi, pertanto, dovrebbe consentire di discriminare le cellule vive (inoculo "attivo") da quelle morte. Un'altra UO, avvalendosi anche della collaborazione di ricercatori dello Scottish Crop Research Institute >>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Gaetano Magnano Di San Lio Università degli Studi "Mediterranea" di REGGIO CALABRIA
Obiettivo del Programma di Ricerca
Gli obiettivi comuni a tutte le Unità di Ricerca (UURR) che partecipano al Programma sono lo sviluppo e la validazione di nuovi metodi di diagnosi molecolare rapidi, sensibili, pratici ed affidabili per lo studio dell'ecologia e dell'epidemiologia di specie invasive di Phytophthora in ambienti naturali o seminaturali ed in ecosistemi forestali e agrari. Questi metodi, inoltre, una volta validati, potranno essere adottati ufficialmente dai Servizi Fitosanitari per la diagnosi delle specie di Phytophthora, quali ad esempio P. ramorum, P. lateralis, P. quercina e P. kernoviae, incluse nelle liste dei patogeni da quarantena (liste A1 e A2 e "alert list") dell' European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO), l'Organismo che in base all'Art. VIII dell' International Plant Protection Convention è riconosciuto quale Organizzazione Regionale di Protezione delle Piante per l'Europa e per i Paesi dell'area Mediterranea.
Tutti i metodi di diagnosi sviluppati dalle UURR che partecipano al Programma si basano sulla PCR in tempo reale ma si differenziano per le sequenze-bersaglio utilizzate per disegnare i primer e per il tipo di applicazione.
Uno dei metodi, alla cui messa a punto collaboreranno due delle quattro UURR, utilizzerà quali marcatori molecolari trascritti (mRNA) dei geni mitocondriali codificanti per la citocromo ossidasi (geni COX), enzima terminale della catena respiratoria. Poichè i geni COX >>>

Durata
24 mesi
Base di partenza scientifica nazionale o internazionale
Phytophthora è un genere del regno dei Chromista che comprende circa 70 specie (Erwin e Ribeiro 1996; Stamps et al., 1990) agenti di gravi malattie di piante spontanee e coltivate di rilevante importanza ecologica ed economica. Alcune specie di Phytophthora, introdotte in ecosistemi naturali, forestali o agrari, possono causare danni di tale gravità da compromettere la stabilità, la biodiversità o la produttività dell’intero sistema.
L’invasione di alcuni di questi patogeni può quindi avere un impatto devastante sulle risorse naturali e sulle colture (Everett, 2000). La globalizzazione del mercato e l’intesificazione degli scambi commerciali tra paesi geograficamente distanti ha aumentato questo rischio. Oggi, per converso, è aumentata la consapevolezza del pericolo dovuto all'introduzione di malattie esotiche associato al commercio di piante non autoctone.
Tra i patogeni vegetali qualificabili come invasivi, certamente il genere Phytophthora assume un’importanza rilevante. Phytophthora ramorum Werres, de Cock and Man in’ t Veld, agente causale del "Sudden Oak Death" (SOD) su diverse specie di Quercus e su Lithocarpus densiflorus in California (Rizzo et al., 2002), e' uno degli esempi piu' noti e più recenti di come un patogeno esotico introdotto in un ambiente favorevole possa provocare gravi danni a migliaia di specie vegetali autoctone e un drammatico deperimento delle foreste in termini di struttura e di biodiversita'. A causa >>>