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INIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE

PROGRAMMA DI RICERCA 2006

italiano - english
Programmi di ricerca simili:
Classificazione scientifico-disciplinare
Classificazione brevettuale
  • CHEMISTRY; METALLURGY
    • BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
      • FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESIZE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE (fermentation processes to form a food composition A21, A23; compounds in general, see the relevant compound class, e.g. C01, C07; brewing of beer C12C; producing vinegar C12J; processes for producing enzymes C12N9/00; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification C12N15/00)
      • MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
      • MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF (biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators, containing micro-organisms, viruses, microbial fungi, enzymes, fermentates or substances produced by or extracted from micro-organisms or animal material A01N63/00; food compositions A21, A23; medicinal preparations A61K; chemical aspects of, or use of materials for, bandages, dressings, absorbent pads or surgical articles A61L; fertilisers C05); PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS (preservation of living parts of humans or animals A01N1/02); MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA (micro-biological testing media C12Q)
Classificazione geografica
Bibliografia
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Parole Chiave
STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS, ANALISI FENOTIPI, VARIABILITÀ GENOMICA, GENOTIPIZZAZIONE, ANALISI FUNZIONALE, BIODIVERSITÀ

Variabilità genetica e analisi funzionale di ceppi di Streptococcus thermophilus di interesse industriale

Università degli Studi di Parma
Abstract
Streptococcus thermophilus è una specie largamente utilizzata per le produzioni lattiero-casearie. Nonostante sia generalmente nota come specie GRAS, S.thermophilus risulta filogeneticamente prossima ad altre specie di streptococchi che comprendono alcuni patogeni umani (S. pneumonie, S. pyogenes, S. agalactiae, S.salivarius).
Il confronto del genoma di S. thermophilus con genomi di streptococchi patogeni pur mettendone in luce la vicinanza filogenetica allo stesso tempo, tuttavia, ha rivelato l’assenza della maggior parte dei determinanti genetici di caratteri di patogenicità o la loro presenza sottoforma di pseudogeni.
La genomica comparativa ha rivelato come l’evoluzione abbia modificato il genoma di S.thermophilus, soprattutto attraverso la perdita di funzioni non essenziali per la sopravvivenza della cellula, e che quindi il percorso evolutivo seguito da questa specie sarebbe diverso da quello delle specie patogene filogeneticamente vicine a causa del suo adattamento ad una nicchia ecologica ben definita quale quella lattiero-casearia.
L’analisi comparativa dei genomi sequenziati di due ceppi di S. thermophilus ha evidenziato un alta similarità del contenuto genico e dell’organizzazione genomica. Il confronto di queste sequenze e di una terza disponibile ancora in forma incompleta, tuttavia, non è sufficiente per fornire una completa visione della variabilità genomica della specie.
Questo ricerca perciò si propone di: a) caratterizzare i >>>

Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Erasmo Neviani Università degli Studi di PARMA
Obiettivo del Programma di Ricerca
La valutazione della variabilità genotipica nei procarioti rappresenta una delle principali aree di ricerca della moderna microbiologia. In questo contesto, la genotipizzazione di batteri lattici, come S. thermophilus, è di grande interesse sia per la ricerca di base che applicata.
Poiché S. thermophilus è una delle specie maggiormente utilizzate nei processi di trasformazione dell’industria lattiero casearia, è di grande interesse acquisire una conoscenza specifica della variabilità genomica di tale specie. Tale conoscenza, associata ad una completa caratterizzazione delle proprietà fenotipiche-fisiologiche, rappresenterà un fondamentale criterio di selezione di ceppi di interesse industriale. Inoltre l’analisi della variabilità genomica rappresenterà un aspetto importante al fine di analizzare i rapporti evolutivi che hanno determinato la speciazione all’interno di questo taxon.
Il primi due obiettivi di questo progetto saranno quelli di caratterizzare fenotipicamente e analizzare la variabilità genomica di S. thermophilus. All’interno di questo obiettivo si possono definire le seguenti fasi
1. Sarà costituita una ceppoteca di S. thermophilus sia con ceppi appartenenti alle collezioni internazionali che con ceppi isolati da diversi prodotti lattiero caseari di diversa provenienza. Questa collezione sarà messa a disposizione di tutte le UR.
2. Di tutti i ceppi sarà effettuata una caratterizzazione fenotipica e genotipica che costituirà gli >>>

Durata
24 mesi
Base di partenza scientifica nazionale o internazionale
I batteri lattici (BL) sono un gruppo di microrganismi funzionalmente correlati, importanti per il ruolo che svolgono nella produzione di alimenti e bevande fermentate. Sono una famiglia eterogenea caratterizzata dalla capacità di trasformare diversi nutrienti in acido lattico. Il loro contributo principale nella produzione di alimenti non è solo da collegare alla rapida acidificazione ma anche la produzione di composti aromatici, e alla modificazione della struttura e del valore nutrizionale. I BL sono utilizzati nell’industria di trasformazione alimentare sotto forma di starter e sono generalmente riconosciuti come GRAS (Generally Recognised As Safe).
Streptococcus thermophilus è una specie ampliamente utilizzata per le produzioni lattiero-casearie ed è considerata come il secondo più importante starter di caseificio industriale dopo Lactococcus lactis (Fox, 1993).
Questo batterio appartiene al gruppo dei BL termofili ed è utilizzato solo o in combinazione con Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus o Lactobacillus helveticus per la produzione di yogurt e formaggi tra i quali, di notevole importanza tra prodotti del nostro paese, quelli duri a pasta cotta vista la resistenza alla temperatura di cottura prevista da questi processi di trasformazione (Fox, 1993; Tamine et al 1980). S.
S.thermophilus è filogeneticamente prossima a L. lactis ma anche ad altre specie di streptococchi tra i quali alcuni patogeni (S. pneumonie, S. pyogenes, S. agalactiae >>>