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PROGRAMMA DI RICERCA 2007
italiano - english
Unità di Ricerca
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Classificazione scientifico-disciplinare
- Area scientifico disciplinare: Scienze chimiche
- Area scientifico disciplinare: Scienze biologiche
Classificazione brevettuale
- CHEMISTRY; METALLURGY
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESIZE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE (fermentation processes to form a food composition A21, A23; compounds in general, see the relevant compound class, e.g. C01, C07; brewing of beer C12C; producing vinegar C12J; processes for producing enzymes C12N9/00; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification C12N15/00)
- MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS (immunoassay G01N33/53); COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- ELECTROLYTIC OR ELECTROPHORETIC PROCESSES; APPARATUS THEREFOR (electrodialysis, electro-osmosis, separation of liquids by electricity B01D; [N: separation of isotopes by electrochemical methods B01D59/38]; working of metal by the action of a high concentration of electric current B23H; treatment of water, waste water or sewage by electrochemical methods C02F1/46; surface treatment of metallic material or coating involving at least one process provided for in class C23 and at least one process covered by this class C23C28/00, C23F17/00; anodic or cathodic protection C23F; single-crystal growth C30B; metallising textiles D06M11/83; decorating textiles by locally metallising D06Q1/04; electrochemical methods of analysis G01N; electrochemical measuring, indicating or recording devices G01R; electrolytic circuit elements, e.g. capacitors, H01G; electrochemical current or voltage generators H01M)
- ELECTROLYTIC OR ELECTROPHORETIC PROCESSES FOR THE PRODUCTION OF COMPOUNDS OR NON-METALS; APPARATUS THEREFOR
- ORGANIC CHEMISTRY (such compounds as the oxides, sulfides, or oxysulfides of carbon, cyanogen, phosgene, hydrocyanic acid or salts thereof C01; products obtained from layered base-exchange silicates by ion-exchange with organic compounds such as ammonium, phosphonium or sulfonium compounds or by intercalation of organic compounds C01B33/44; macromolecular compounds C08; dyes C09; fermentation products C12; fermentation or enzyme-using processes to synthesise a desired chemical compound or composition or to separate optical isomers from a racemic mixture C12P; production of organic compounds by electrolysis or electrophoresis C25B3/00, C25B7/00)
- PEPTIDES (peptides in foodstuffs A23; obtaining protein compositions for foodstuffs, working-up proteins for foodstuffs A23J; preparations for medicinal purposes A61K; peptides containing beta-lactam rings C07D; cyclic dipeptides not having in their molecule any other peptide link than those which form their ring, e.g. piperazine-2,5-diones, C07D; ergot alkaloids of the cyclic peptide type C07D519/02; macromolecular compounds having statistically distributed amino acid units in their molecules, i.e. when the preparation does not provide for a specific; but for a random sequence of the amino acid units, homopolyamides and block copolyamides derived from amino acids C08G69/00; macromolecular products derived from proteins C08H1/00; preparation of glue or gelatine C09H; single cell proteins, enzymes C12N; genetic engineering processes for obtaining peptides C12N15/00; compositions for measuring or testing processes involving enzymes C12Q; investigation or analysis of biological material G01N33/00)
- BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Classificazione geografica
- Regione: Emilia Romagna
Parole Chiave
BIOSENSORI, TRASPORTO ELETTRONICO, BIOELETTROCHIMICA, EME-PROTEINE, INGEGNERIA E SINTESI PROTEICASviluppo di biosensori elettrochimici di terza generazione basati su eme-proteine ingegnerizzate e sintetiche
Università degli Studi di Modena e Reggio EmiliaAbstract
Questo progetto è dedicato allo sviluppo di interfacce biocatalitiche nano-strutturate formate da monostrati auto-assemblati di eme-proteine ancorate ad elettrodi solidi, da utilizzare per la realizzazione di biosensori di ultima (terza) generazione dedicati alla rivelazione e al dosaggio di analiti di interesse ambientale e clinico e per lo screening ad alte prestazioni di nuovi farmaci.L’attività proposta è inserita nel settore emergente dell’elettronica bio-molecolare, nel quale le proprietà redox di molecole biologiche vengono sfruttate per la produzione di dispositivi di memoria massiva, transistor e biosensori che possono raggiungere livelli di efficienza, sensibilità e miniaturizzazione senza precedenti. I biosensori rappresentano il filone applicativo più promettente, grazie alle sconfinate opportunità offerte dal riconoscimento biomolecolare per la rivelazione di analiti in vitro e in vivo. La risposta in corrente (amperometrica) viene ottenuta dalla ossidazione/riduzione elettrocatalitica del substrato operata da enzimi immobilizzati sull’elettrodo. Le opportunità offerte dalla nano-fabbricazione di elettrodi aprono la strada per il biosensing di metaboliti in cellule viventi.
Nello specifico, l’attività proposta è centrata sull’utilizzazione di eme-proteine come componenti delle interfacce biocatalitiche in oggetto. Questa scelta è dettata dal fatto che il gruppo eme è in grado di catalizzare l’ossidazione/riduzione di una grande varietà di >>>
Coordinatore Scientifico del Programma di Ricerca
Marco Sola Università degli Studi di MODENA e REGGIO EMILIAObiettivo del Programma di Ricerca
Il presente progetto propone lo sviluppo di eme-proteine ingegnerizzate e sintetiche per applicarle come componenti di interfacce biocatalitiche nanostrutturate in biosensori di terza generazione per la rivelazione ad alta efficienza e la determinazione quantitativa di chemicals e metaboliti di interesse ambientale (xenobiotici) e clinico.La ricerca ha l’obiettivo di sfruttare le straordinarie potenzialità di riconoscimento molecolare e catalitiche delle eme-proteine, modulate su base razionale, per ottenere specie immobilizzate su elettrodi solidi in grado di fornire una risposta amperometrica quantitativa nei confronti di determinati bersagli molecolari. Il raggiungimento di questo obiettivo comporta l’articolazione della ricerca in una serie di direttrici che includono:
a) la comprensione delle basi molecolari di vari aspetti dei rapporti struttura-proprietà-funzione delle proteine in esame, che costituisce un prerequisito essenziale per:
b) la progettazione razionale di opportune modifiche strutturali per indurre, modulare e ottimizzare l’attività catalitica di specie ricombinanti attraverso tecniche di ingegneria genetica o guidare la sintesi nuove eme-proteine artificiali dotate di una funzione specifica;
c) ottenere l’immobilizzazione in condizioni non denaturanti di queste specie su elettrodi solidi attraverso la formazione di strutture nanometriche auto-assemblate che ottimizzino la risposta elettrochimica;
d) migliorare la >>>
Risultati parziali attesi
I principali risultati che prevediamo di conseguire sulla base delle conoscenze acquisite dai proponenti nei rispettivi settori di indagine e sulla base del potenziale umano disponibile e delle sinergie che si realizzeranno fra i gruppi di ricerca in termini di know-how scientifico e strumentazione disponibile, sono elencati di seguito.1. Produzione di mutanti del cytP450 umano con una singola cisteina superficiale che, immobilizzati covalentemente in modo orientato su elettrodo d’oro, siano in grado di produrre correnti catalitiche nelle titolazioni con farmaci di diverse classi (antibiotici, antiinfiammatori, antidepressivi). I parametri di attività enzimatica KM e Vmax ottenuti forniranno importanti indicazioni sulla degradazione dei farmaci da parte del cytcP450.
2. Costruzione di microarrays contenenti le tre diverse isoforme di cytP450 umano immobilizzate su elettrodo d’oro per realizzare un metodo di screening ad alte prestazioni in grado di testare in modo efficace e veloce la detossificazioe dei potenziali nuovi farmaci nel fegato umano, facilitando così il processo di drug discovery nei primi stadi.
3. Produzione di mutanti del citocromo P450 BM3 da Bacillus megaterium che, immobilizzati su elettrodi d’oro, permettano di costruire un biosensore in grado di monitorare la presenza di inquinanti ambientali, con particolare riferimento ai PAH, con elevata sensibilità.
4. Produzione dei mutanti M80A e M80A/Y67H del citocromo c da >>>



