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INIZIO_TESTO_DA_INDICIZZARE

UNITA' DI RICERCA

italiano - english
Bibliografia
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Programma di ricerca

Aspetti molecolari di patologie conformazionali proteiche. Ruolo dei fattori ambientali sulle variazioni strutturali di proteine per la progettazione e la sintesi di agenti ad attività antiaggregante, antiossidante, antiglicante e chelante nonchè per applicazioni in diagnostica.
Università di riferimento
Università degli Studi di PARMA - CHIMICA GENERALE ED INORGANICA, CHIMICA ANALITICA, CHIMICA FISICA - PARMA(PR)
Responsabile dell'Unità di ricerca
Giancarlo PELIZZI
Descrizione
Lo scopo del lavoro è la caratterizzazione dei requisiti conformazionali per l'associazione di derivati di rifamicine alla DDRP. Questa indagine, in assenza di informazioni strutturali dirette sul sito di interazione e sulla stessa DDRP, può fornire una potenziale mappatura funzionale del farmacoforo, e chiarire il meccanismo conformazionale di azione delle rifamicine. Questo scopo verrà perseguito considerando due aspetti: la collezione e l'analisi delle conformazioni adottate dalle rifamicine allo stato solido, e, in secondo luogo, la mappatura delle interazioni che nel cristallo circondano i gruppi funzionali delle molecole. Il primo aspetto si inserisce in studi tradizionali di correlazione fra attività e struttura, e verrà sviluppato con l'ausilio anche di strumenti chemiometrici e di modellistica molecolare, in particolare caratterizzando i requisiti conformazionali necessari per l'attività biologica integrati da misure di coefficiente di ripartizione. Il meccanismo e le caratteristiche strutturali del binding verranno inoltre caratterizzati mediante metodi spettrofotometrici UV, NMR e mediante misure di energia di legame attraverso metodi calorimetrici. Il secondo aspetto verrà sviluppato studiando la possibilità di controllare il polimorfismo conformazionale delle rifamicine, con l'obiettivo di caratterizzare la disposizione tridimensionale e le caratteristiche elettrostatiche ottimali dei gruppi funzionali che circondano la rifamicina in differenti situazioni conformazionali, per mezzo di un campionamento di diverse forme cristalline di diversi derivati e dei relativi solvati di cristallizzazione. Questo potrebbe portare ad una mappatura della più probabile disposizione tridimensionale dei siti di interazione tra il farmaco e la proteina. Parallelamente, sarà valutata la possibilità di usare i tre leucoidrossidi del sunset orange, malachite green e crystal violet come composti "caged-OH". E' noto, infatti, che queste sostanze sono in grado di liberare ioni OH- [33], ma la loro caratterizzazione chimica e fotochimica è incompleta. Un altro obiettivo che ci si pone è la sintesi di derivati con una maggiore solubilità in acqua. La caratterizzazione chimico-fisica di questi composti é preliminare al loro impiego nello studio dei processi di folding/unfolding indotti da salti di pH.